More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5324 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5324  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  100 
 
 		 301 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1710  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  100 
 
 		 301 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0190  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  54.08 
 
 		 305 aa  325  5e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1506  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  52.16 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2689  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  53.56 
 
 		 299 aa  310  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4380  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  52.54 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4512  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  52.54 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0398112  normal  0.511989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2472  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.34 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1193  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.57 
 
 		 301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2358  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  44.88 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0202  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  52.04 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3877  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50 
 
 		 326 aa  275  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3458  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  49.5 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1716  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  46.62 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3540  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  39.93 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2240  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  39.66 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.91 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0386  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.71 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2496  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  41.14 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000223709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4626  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  37.86 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1442  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  37.63 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0541473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1899  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  33.57 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.49 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.74 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.55 
 
 		 331 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.37 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.37 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.37 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.25 
 
 		 282 aa  129  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.38 
 
 		 283 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 		 361 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.8 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.34 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.25 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.59 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.97 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.43 
 
 		 314 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.58 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.93 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  30.82 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  28.2 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.87 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.76 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.04 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.11 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.76 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0101  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  28.99 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630999  hitchhiker  0.000002029 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.87 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.08 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.83 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.24 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.36 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.42 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  27.82 
 
 		 326 aa  108  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.86 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.96 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.4 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.25 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.52 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.9 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.69 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.9 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.87 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1425  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.5 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000869959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.78 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  27.96 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.86 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0043  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.78 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.270111  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.57 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  28.52 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.08 
 
 		 324 aa  105  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.584149  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.14 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.39 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.48 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.59 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.17 
 
 		 317 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.16 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.53 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.17 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.13 
 
 		 325 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.23 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.13 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.15 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.68 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.15 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.17 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.29 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.8 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.02 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.8 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.62 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.85 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0717  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.9 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.156805  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.15 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.8 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.13 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.62 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.45 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>