More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1221 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
337 aa  692    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  77.45 
 
 
337 aa  560  1.0000000000000001e-159  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1015  ribose-phosphate diphosphokinase  70.91 
 
 
344 aa  482  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0881  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.54 
 
 
327 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.328682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0987  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.09 
 
 
326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.85 
 
 
327 aa  451  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0717  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.34 
 
 
316 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.156805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.31 
 
 
327 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.06 
 
 
326 aa  423  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2708  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.77 
 
 
327 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.12 
 
 
334 aa  417  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.76 
 
 
326 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.18 
 
 
326 aa  408  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.13 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.38 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0656  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.06 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.75 
 
 
325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.32 
 
 
325 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  58.77 
 
 
325 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.85 
 
 
326 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.37 
 
 
325 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.85 
 
 
325 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.46 
 
 
324 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.62 
 
 
326 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3962  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.78 
 
 
324 aa  384  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13390  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
326 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.271989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0909  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.88 
 
 
347 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11035  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.41 
 
 
326 aa  381  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.54 
 
 
325 aa  381  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1943  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.41 
 
 
326 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.985471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
322 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.5 
 
 
324 aa  378  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4628  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.46 
 
 
326 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal  0.568111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4249  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.46 
 
 
326 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4335  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.46 
 
 
326 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.46 
 
 
326 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.62 
 
 
322 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.6 
 
 
326 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 
326 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
326 aa  364  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.78 
 
 
323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 
314 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47 
 
 
325 aa  293  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.77 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.69 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.41 
 
 
316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.23 
 
 
331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 
315 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.09 
 
 
317 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 
317 aa  279  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.67 
 
 
319 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.5 
 
 
315 aa  277  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.67 
 
 
316 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.43 
 
 
331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.7 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.48 
 
 
319 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.48 
 
 
319 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.08 
 
 
314 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.3 
 
 
318 aa  269  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  44.09 
 
 
317 aa  269  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.62 
 
 
318 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.69 
 
 
313 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.62 
 
 
318 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.99 
 
 
338 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.37 
 
 
322 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.96 
 
 
331 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.22 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.59 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.24 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.91 
 
 
331 aa  266  4e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03970  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.04 
 
 
321 aa  265  7e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.579813 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.87 
 
 
312 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.41 
 
 
330 aa  265  8.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.77 
 
 
330 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.74 
 
 
316 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.22 
 
 
331 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.34 
 
 
332 aa  263  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.72 
 
 
330 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.44 
 
 
314 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.22 
 
 
322 aa  262  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  42.54 
 
 
327 aa  262  6e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.43 
 
 
316 aa  262  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.68 
 
 
329 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.48 
 
 
316 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.09 
 
 
331 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.9 
 
 
331 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.61 
 
 
325 aa  261  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.87 
 
 
313 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.04 
 
 
337 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.87 
 
 
312 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.99 
 
 
326 aa  260  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>