More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0717 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0717  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 316 aa  645    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.156805  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1015  ribose-phosphate diphosphokinase  91.14 
 
 		 344 aa  597  1e-170  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0987  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.26 
 
 		 326 aa  455  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0881  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.94 
 
 		 327 aa  454  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.328682 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  65.82 
 
 		 337 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.34 
 
 		 337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.61 
 
 		 327 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.62 
 
 		 327 aa  444  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.66 
 
 		 326 aa  429  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2708  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.64 
 
 		 327 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.68 
 
 		 334 aa  421  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67 
 
 		 326 aa  421  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13390  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.67 
 
 		 326 aa  411  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.271989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.02 
 
 		 326 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0656  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.7 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.03 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0909  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.7 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.03 
 
 		 325 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.82 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4249  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.69 
 
 		 326 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11035  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.02 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4335  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.69 
 
 		 326 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4628  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.69 
 
 		 326 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal  0.568111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.59 
 
 		 326 aa  391  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.03 
 
 		 325 aa  391  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.7 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1943  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.7 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.985471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  61.06 
 
 		 325 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.02 
 
 		 326 aa  381  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.6 
 
 		 326 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.93 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.31 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.39 
 
 		 322 aa  374  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.72 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.92 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.93 
 
 		 325 aa  371  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.73 
 
 		 326 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3962  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.59 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.59 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.73 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.95 
 
 		 323 aa  334  9e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.17 
 
 		 315 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.5 
 
 		 315 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.15 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 		 325 aa  295  5e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 		 316 aa  292  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.01 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.86 
 
 		 317 aa  288  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.01 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.37 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.53 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.53 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.53 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.53 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.53 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.53 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.53 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.53 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.53 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 		 329 aa  285  5.999999999999999e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.53 
 
 		 317 aa  285  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.87 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.06 
 
 		 319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.67 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.85 
 
 		 316 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.54 
 
 		 315 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.84 
 
 		 331 aa  278  9e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  46.15 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.36 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.52 
 
 		 331 aa  275  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.36 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.51 
 
 		 314 aa  275  9e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.58 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.39 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.4 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.17 
 
 		 316 aa  272  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.86 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.21 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.84 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.36 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.08 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  43.89 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.35 
 
 		 330 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.19 
 
 		 314 aa  268  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.7 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.52 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.19 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03970  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.39 
 
 		 321 aa  265  7e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.579813 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.85 
 
 		 321 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.18 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.85 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.85 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  45.54 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.25 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>