281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3305 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 147 aa  301  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  98.64 
 
 		 147 aa  300  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  61.83 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  62.31 
 
 		 140 aa  174  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  51.13 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  42.74 
 
 		 154 aa  126  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  40.5 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  38.33 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  32.06 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  39.05 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  30.51 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  30.51 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  30.51 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  29.29 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  28.26 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  31.93 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  27.74 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  28.81 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  32.8 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  30.07 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.08 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  29.17 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4436  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  30.26 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  26.05 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  25.4 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  31.03 
 
 		 181 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  34.15 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  31.03 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  31.03 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  31.03 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  31.03 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  26.5 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  31.03 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  29.1 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  27.87 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  23.19 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  27.34 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  26.72 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  30.97 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>