More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4090 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 444 aa  874    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  52.4 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.5 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.58 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  45.73 
 
 		 454 aa  329  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 453 aa  325  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 497 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.612622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3773  ATPase domain-containing protein  45.82 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0284842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4067  histidine kinase  51.28 
 
 		 491 aa  247  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.933577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 443 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  46.45 
 
 		 458 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 453 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  32.16 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  42.86 
 
 		 276 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 493 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 494 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5209  two component sensor kinase  31.77 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 535 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  37.93 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  37.39 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  40.85 
 
 		 391 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 453 aa  187  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 443 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  32.18 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 480 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 442 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 454 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 443 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 717 aa  179  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 349 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  31.87 
 
 		 443 aa  177  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 330 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.29 
 
 		 396 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  37.72 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  34.91 
 
 		 474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3730  histidine kinase  39.36 
 
 		 458 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  41.03 
 
 		 270 aa  173  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  35.4 
 
 		 499 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  32.39 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 488 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 493 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  37.84 
 
 		 438 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  36.33 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 456 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  34.95 
 
 		 344 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  37.16 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  34.97 
 
 		 440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  33.83 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 488 aa  160  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 455 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  36.3 
 
 		 448 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  33.46 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  31.97 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  39.77 
 
 		 358 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 428 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 484 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 464 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  35.5 
 
 		 473 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  35.11 
 
 		 482 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 436 aa  153  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>