More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4551 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  83.27 
 
 		 508 aa  833    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 508 aa  1010    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  31.08 
 
 		 502 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.46 
 
 		 501 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  31.53 
 
 		 497 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  34.58 
 
 		 511 aa  232  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  31.56 
 
 		 538 aa  231  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  34.15 
 
 		 504 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  37.4 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.59 
 
 		 512 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.86 
 
 		 496 aa  217  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  35.35 
 
 		 512 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.27 
 
 		 500 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  33.79 
 
 		 509 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.19 
 
 		 518 aa  213  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.29 
 
 		 511 aa  209  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  31.75 
 
 		 515 aa  209  9e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  32.11 
 
 		 498 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  28.66 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  30.92 
 
 		 512 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  28.68 
 
 		 509 aa  203  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.05 
 
 		 500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.74 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.03 
 
 		 502 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  31.49 
 
 		 506 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  31.99 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  27.66 
 
 		 499 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  28.29 
 
 		 506 aa  196  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  31.83 
 
 		 524 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.08 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0722  carbohydrate kinase, FGGY  33.33 
 
 		 491 aa  195  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  29.33 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  29.75 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  29.8 
 
 		 501 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  31.36 
 
 		 494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  28.52 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.48 
 
 		 492 aa  191  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  31.86 
 
 		 514 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.48 
 
 		 492 aa  191  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  31.36 
 
 		 494 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  30.14 
 
 		 503 aa  190  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.47 
 
 		 496 aa  190  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.47 
 
 		 490 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  31.14 
 
 		 494 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  31.36 
 
 		 494 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  30.77 
 
 		 499 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  31.64 
 
 		 484 aa  186  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  32.6 
 
 		 472 aa  186  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  33.47 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  28.07 
 
 		 528 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0613  carbohydrate kinase, FGGY  26.9 
 
 		 481 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.116215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1584  carbohydrate kinase FGGY  25.26 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  29.71 
 
 		 472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  25.64 
 
 		 506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  31.3 
 
 		 517 aa  181  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.94 
 
 		 510 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.38 
 
 		 509 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  29.18 
 
 		 499 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  31.3 
 
 		 517 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  32.1 
 
 		 501 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  29.21 
 
 		 500 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  29.21 
 
 		 500 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  29.21 
 
 		 500 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  31.66 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  32.22 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  29.08 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  28.8 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  29.71 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  26.58 
 
 		 503 aa  178  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  27.55 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  28.96 
 
 		 500 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  28.8 
 
 		 500 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  28.4 
 
 		 496 aa  177  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  29.71 
 
 		 472 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  28.19 
 
 		 496 aa  176  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  32.02 
 
 		 487 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  25.31 
 
 		 505 aa  177  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  28.42 
 
 		 472 aa  176  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  32.19 
 
 		 501 aa  176  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  29.5 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  32.02 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  28.4 
 
 		 505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  29.72 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  28.42 
 
 		 482 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1215  glycerol kinase  28.06 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1188  glycerol kinase  28.03 
 
 		 500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  33.13 
 
 		 499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  29.44 
 
 		 519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  28.21 
 
 		 482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  30.52 
 
 		 498 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  28.21 
 
 		 472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  28.21 
 
 		 482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.94 
 
 		 530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  27.01 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  31.71 
 
 		 548 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  30.72 
 
 		 498 aa  174  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  28.21 
 
 		 472 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  28.21 
 
 		 472 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  28.21 
 
 		 472 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  28.8 
 
 		 474 aa  172  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>