49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4546 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  100 
 
 		 690 aa  1391    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  39.28 
 
 		 983 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3555  hypothetical protein  44.37 
 
 		 616 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1241 aa  217  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  54.87 
 
 		 1202 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  55.41 
 
 		 812 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  32.43 
 
 		 1323 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 568 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0097  Cna B domain-containing protein  70.19 
 
 		 135 aa  142  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1877  hypothetical protein  35.44 
 
 		 607 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215725  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3273  hypothetical protein  28.11 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000120347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0098  Cna B domain-containing protein  51.43 
 
 		 138 aa  126  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.685071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  35.65 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3274  hypothetical protein  25.69 
 
 		 587 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  32.34 
 
 		 635 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0739  Cna B domain-containing protein  38.03 
 
 		 536 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000604676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  32.86 
 
 		 653 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3936  Cna B domain-containing protein  39.63 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0567855  normal  0.0675553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3284  hypothetical protein  26.71 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.323692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  39.6 
 
 		 1578 aa  70.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  37.74 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  31.2 
 
 		 550 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  37.18 
 
 		 681 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2620  Cna B domain protein  42.86 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208215  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  35.62 
 
 		 2656 aa  57.4  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 804 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3164  Cna B-type  25.55 
 
 		 980 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592408  normal  0.0320112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  40.86 
 
 		 1407 aa  51.2  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  32.95 
 
 		 2474 aa  51.2  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  32.5 
 
 		 3373 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.21 
 
 		 1501 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.56 
 
 		 1710 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1514 aa  48.9  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  35.8 
 
 		 727 aa  48.5  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1192  hypothetical protein  35.25 
 
 		 679 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000450505  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  35.71 
 
 		 1672 aa  47.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  33.12 
 
 		 693 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.66 
 
 		 753 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  28.04 
 
 		 531 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  33.13 
 
 		 738 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04230  Cna B domain protein  31.47 
 
 		 609 aa  45.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.63 
 
 		 2182 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  40.28 
 
 		 747 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  42.19 
 
 		 788 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1075 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  39.08 
 
 		 884 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.83 
 
 		 2171 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 998 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  36.99 
 
 		 799 aa  44.3  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>