48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3333 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3333  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  770    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  85.75 
 
 		 407 aa  556  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  49.01 
 
 		 412 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 435 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 421 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  22.87 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 461 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3282  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  27.13 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  36.84 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 459 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  26.72 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  26.46 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  28.3 
 
 		 477 aa  44.3  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  26.01 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 501 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  28.46 
 
 		 370 aa  43.5  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 451 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  25.9 
 
 		 397 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 397 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 485 aa  43.1  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>