91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3257 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  100 
 
 		 422 aa  842    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  94.55 
 
 		 422 aa  808    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  58.68 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  49.75 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  50 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  48.06 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  50.73 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  49.88 
 
 		 412 aa  405  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  48.54 
 
 		 412 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  48.67 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  37.94 
 
 		 528 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  37.24 
 
 		 533 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  39.56 
 
 		 516 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  37.68 
 
 		 540 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  37.47 
 
 		 535 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  39.32 
 
 		 508 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  38.59 
 
 		 508 aa  276  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  39.08 
 
 		 508 aa  276  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  38.73 
 
 		 509 aa  275  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1609  chlorophyllide reductase subunit Y  38.01 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  36.65 
 
 		 512 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  38.93 
 
 		 502 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  36.71 
 
 		 513 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  37.68 
 
 		 521 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  38.69 
 
 		 502 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  37.41 
 
 		 500 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  36.77 
 
 		 534 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2979  chlorophyllide reductase subunit Y  37.14 
 
 		 468 aa  256  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.927182  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  31.48 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  29.6 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.64 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.85 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.46 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  21.74 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  21.43 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  21.74 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.93 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.1 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  24.54 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  21.26 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.91 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.74 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.07 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.26 
 
 		 467 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  24.53 
 
 		 505 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.45 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.33 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.2 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.55 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.55 
 
 		 525 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.49 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.62 
 
 		 523 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  22.64 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  22.46 
 
 		 462 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.91 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.67 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.32 
 
 		 531 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.81 
 
 		 525 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.7 
 
 		 523 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  22.28 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.35 
 
 		 466 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.72 
 
 		 533 aa  50.4  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  18.94 
 
 		 458 aa  49.7  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  21.98 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.92 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.11 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  27.56 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.54 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.18 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.3 
 
 		 524 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.47 
 
 		 511 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.32 
 
 		 526 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  27.46 
 
 		 466 aa  47.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.43 
 
 		 541 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.21 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  19.94 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.58 
 
 		 525 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.5 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.06 
 
 		 530 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.96 
 
 		 535 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.81 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  22.83 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.17 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.78 
 
 		 546 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.28 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.69 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  23.36 
 
 		 469 aa  43.9  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.34 
 
 		 508 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.92 
 
 		 526 aa  43.1  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.52 
 
 		 519 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  23.62 
 
 		 516 aa  43.1  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>