More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3120 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
366 aa  736    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  89.07 
 
 
366 aa  643    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  64.58 
 
 
375 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  47.41 
 
 
375 aa  357  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
390 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
390 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2857  group 1 glycosyl transferase  33.59 
 
 
391 aa  217  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1099  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 
388 aa  216  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 
395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6087  glycosyl transferase group 1  40.07 
 
 
394 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0801874  hitchhiker  0.00307291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
360 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
360 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
373 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
398 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
426 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
367 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
370 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  34.62 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
419 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  40.1 
 
 
395 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
457 aa  96.3  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
386 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
421 aa  93.6  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  43.15 
 
 
404 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
392 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
452 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  29.91 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
405 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
392 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
417 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
409 aa  89.7  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
433 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  31.53 
 
 
403 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
405 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5501  glycosyl transferase group 1  36.23 
 
 
378 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205399  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
415 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.66 
 
 
409 aa  87  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
370 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  38.36 
 
 
407 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
367 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
386 aa  86.7  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
384 aa  86.3  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
904 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.43 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  30.87 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
440 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
613 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  28.64 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2754  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.12 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.12 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>