More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2978 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  93.18 
 
 		 264 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  73.64 
 
 		 259 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  66.54 
 
 		 270 aa  355  3.9999999999999996e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  65.75 
 
 		 255 aa  341  9e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  64 
 
 		 271 aa  329  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  62.35 
 
 		 268 aa  317  9e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  64.78 
 
 		 271 aa  308  5.9999999999999995e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  64.66 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  59.44 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  59.76 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  53.64 
 
 		 261 aa  295  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  53.78 
 
 		 256 aa  291  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  56.8 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  55.95 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  55.56 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  52.9 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  58.43 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  55.38 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  55.43 
 
 		 261 aa  288  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  56.97 
 
 		 255 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  55.78 
 
 		 256 aa  288  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  55.16 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  53.28 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.78 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  54.83 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  56.76 
 
 		 257 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  55.29 
 
 		 271 aa  285  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  54.44 
 
 		 284 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  56.37 
 
 		 257 aa  285  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  54.81 
 
 		 288 aa  284  9e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  54.65 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  54.44 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  57.09 
 
 		 261 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  55.78 
 
 		 255 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  54.8 
 
 		 256 aa  281  6.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  55.82 
 
 		 275 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  55.82 
 
 		 275 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  55.82 
 
 		 275 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  55.02 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.7 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  55.38 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  54.72 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  55.02 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  53.57 
 
 		 252 aa  279  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  54.4 
 
 		 259 aa  278  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  54.84 
 
 		 271 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.59 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  55.78 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  52.38 
 
 		 281 aa  277  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  52.59 
 
 		 270 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  55.42 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  50 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  56.4 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  54.62 
 
 		 293 aa  275  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  52.14 
 
 		 257 aa  275  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  54.4 
 
 		 259 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  52.19 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  53.82 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  49.66 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  54.51 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  54.18 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  54.8 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  58.33 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  52.78 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  55.2 
 
 		 258 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  53.39 
 
 		 261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  50.59 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  52.55 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  54.12 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  54.4 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  54.22 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  54.4 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.79 
 
 		 255 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  54.4 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.19 
 
 		 255 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  51.79 
 
 		 255 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54 
 
 		 258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.39 
 
 		 255 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  53.01 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  51.56 
 
 		 255 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  51 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  53.78 
 
 		 258 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.6 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  53.17 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  54.22 
 
 		 280 aa  265  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  51.81 
 
 		 612 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  51.56 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  51.19 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  53.2 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  53.33 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  53.33 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  54.37 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  51.41 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  51.59 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  52.59 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>