41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2739 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  89.43 
 
 		 411 aa  689    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  100 
 
 		 408 aa  797    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  31.34 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  35.89 
 
 		 428 aa  99.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  31.2 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  32.54 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  34.62 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  33.76 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  31.03 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  33.18 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  32.68 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  33.83 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  32.08 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  35.08 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  32.82 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  32.42 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  29.53 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  34.16 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  31.78 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  35.48 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  30.95 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  28.53 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  28.53 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  30.42 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  28.53 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  29.19 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  34.01 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  31.03 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  31.64 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  32.19 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  31.66 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  32.03 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  30 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  32.48 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  28.49 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  32.62 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  31.28 
 
 		 425 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  31.51 
 
 		 228 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  32.8 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  33.94 
 
 		 225 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>