More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1344 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 84 aa  171  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  97.62 
 
 		 84 aa  167  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  62.03 
 
 		 81 aa  110  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  58.67 
 
 		 80 aa  100  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  58.67 
 
 		 194 aa  100  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  58.57 
 
 		 80 aa  98.2  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  58.67 
 
 		 80 aa  97.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  56 
 
 		 80 aa  97.8  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  54.67 
 
 		 80 aa  97.4  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  58.67 
 
 		 175 aa  96.7  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  52 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  54.93 
 
 		 76 aa  90.1  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  50.77 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  44.29 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  44.29 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  45.83 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  46.48 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  40.28 
 
 		 78 aa  70.1  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  49.25 
 
 		 76 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  41.67 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  38.03 
 
 		 384 aa  67  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  43.94 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  43.66 
 
 		 402 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  36.62 
 
 		 383 aa  64.3  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  47.69 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  47.69 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  41.03 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  37.5 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  34.21 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  46.15 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  38.46 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  27.27 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  40 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  40.58 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  44.12 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  42.47 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  38.81 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  43.94 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  32 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  42.03 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  33.33 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  32.81 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  41.67 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  40 
 
 		 398 aa  55.1  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  33.87 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  27.4 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  30.99 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  35.14 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  37.5 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  36.36 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  32.39 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  39.06 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  35.82 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  41.18 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  36.99 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  31.34 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  31.34 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  39.06 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1784  glutaredoxin and related proteins  32.14 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  33.33 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  29.58 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  36.23 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  36.11 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  40.62 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  40.62 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  36.62 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  34.85 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  38.57 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  34.85 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  35.48 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.29 
 
 		 459 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  35.48 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  34.78 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  35.48 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  35.48 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  34.33 
 
 		 245 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  35.48 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  35.48 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>