271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0579 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  80.9 
 
 		 183 aa  289  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  44.63 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  50.99 
 
 		 149 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  53.95 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  49.67 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  47.33 
 
 		 150 aa  150  8.999999999999999e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  46.24 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  46.5 
 
 		 194 aa  147  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  49.03 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  48.47 
 
 		 188 aa  140  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  37.57 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  47.4 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  49.33 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  41.94 
 
 		 156 aa  134  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  41.14 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  45.7 
 
 		 155 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  49.06 
 
 		 156 aa  131  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  47.44 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  46.36 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  42 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  46.36 
 
 		 150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  47.25 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  51.35 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  52.26 
 
 		 155 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  40.33 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  45.62 
 
 		 157 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  40.33 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  51.05 
 
 		 149 aa  127  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  45.06 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  43.83 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  44.38 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  44.97 
 
 		 169 aa  124  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  50.31 
 
 		 159 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  50.31 
 
 		 159 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  41.03 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  51.9 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  44.97 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  41.29 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  47.53 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  42 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  43.14 
 
 		 159 aa  114  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  40.13 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  42.07 
 
 		 617 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  46 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  42.47 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  42.25 
 
 		 153 aa  111  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  42.11 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  36.32 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  41.55 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  44.38 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  37.5 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  49.38 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  45.96 
 
 		 158 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  38.56 
 
 		 158 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  42.76 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  39.46 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  38.73 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  38.73 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  43.75 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  43.42 
 
 		 158 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  38.89 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  43.75 
 
 		 159 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  38.31 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  37.2 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  36.36 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  39.73 
 
 		 201 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  38.61 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  38.99 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  37.95 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  38.89 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  35.62 
 
 		 177 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  40.91 
 
 		 154 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  35.44 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  36.65 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  36.71 
 
 		 180 aa  95.1  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  38.12 
 
 		 180 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  41.61 
 
 		 150 aa  94.4  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  36.65 
 
 		 177 aa  94.4  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0279  PBP family phospholipid-binding protein  39.75 
 
 		 200 aa  94.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  38.22 
 
 		 179 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  39.16 
 
 		 167 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  36.65 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  55.79 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  35.37 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  34.76 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  37.01 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2434  PEBP family protein  37.27 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0392819  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  34.97 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  36.94 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  40.25 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3225  PBP family phospholipid-binding protein  34.97 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  40.27 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3175  PBP family phospholipid-binding protein  34.97 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  37.5 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4403  PEBP family protein  41.51 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  37.24 
 
 		 155 aa  92  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  38.69 
 
 		 190 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  42.58 
 
 		 178 aa  91.7  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>