More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0139 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0139  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 330 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0392  polyprenyl synthetase  71.7 
 
 		 317 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0899  Polyprenyl synthetase  46.25 
 
 		 361 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0021773  hitchhiker  0.000000547465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  38.74 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  37.84 
 
 		 349 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2345  polyprenyl synthetase  38.32 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000529379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.48 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.83 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.17 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  34.81 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  32.91 
 
 		 318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  26.52 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  31.59 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.68 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  30.43 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  30.52 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  30.25 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  25.39 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3069  Polyprenyl synthetase  41.11 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.197227  unclonable  0.0000000203915 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  25.39 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  29.58 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  29.56 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  26.18 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  31.09 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  30.35 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  27.74 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.38 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  31.65 
 
 		 337 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  29.82 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  31.53 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3676  trans-hexaprenyltranstransferase  30.69 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  25.89 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  31.18 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  28.06 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  26.84 
 
 		 322 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  30.77 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  30 
 
 		 336 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  30.06 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  32.68 
 
 		 359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  29.57 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  30.42 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  29.32 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  28.83 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  28.83 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  31.47 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  29.08 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  31.78 
 
 		 356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  29.18 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  26.84 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.18 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  29.64 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  26.69 
 
 		 324 aa  110  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  26.03 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.09 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  23.97 
 
 		 319 aa  109  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.49 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  28.62 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  26.23 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  28.47 
 
 		 325 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  29.41 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  31.93 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  28.12 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.9 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  28.86 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  29.3 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  29.14 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  28.3 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  31.5 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  31.1 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.67 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  28.86 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.12 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.11 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  30.03 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  27.51 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1254  Polyprenyl synthetase  33.5 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.11 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0545  Trans-hexaprenyltranstransferase  27.71 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  28.42 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.35 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  26.54 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.77 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.77 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  29.64 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  28.16 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  28.99 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.77 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.77 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  31.83 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.77 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  28.99 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  28.99 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  26.11 
 
 		 324 aa  105  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  28.57 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  31.37 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  24.32 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  27.8 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>