68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3975 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  67.61 
 
 		 941 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  100 
 
 		 835 aa  1612    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  55.24 
 
 		 787 aa  485  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  53.05 
 
 		 799 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  53.29 
 
 		 799 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  45.37 
 
 		 874 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  44.26 
 
 		 857 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  44.44 
 
 		 857 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  44.16 
 
 		 907 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  48.2 
 
 		 846 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  44.98 
 
 		 871 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  43.51 
 
 		 915 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  47.64 
 
 		 769 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  38 
 
 		 848 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  46.67 
 
 		 842 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  46.14 
 
 		 904 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  44.89 
 
 		 856 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  44.26 
 
 		 856 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  43.75 
 
 		 857 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  42.37 
 
 		 858 aa  353  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  43.89 
 
 		 855 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  48.91 
 
 		 367 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  48.91 
 
 		 367 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  46.52 
 
 		 639 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  40.13 
 
 		 762 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  40.69 
 
 		 719 aa  288  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  38.34 
 
 		 740 aa  251  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  43.7 
 
 		 790 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  38.14 
 
 		 741 aa  217  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  36.81 
 
 		 680 aa  205  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  30.98 
 
 		 704 aa  151  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  25.68 
 
 		 784 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  37.2 
 
 		 438 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  44.83 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  37.82 
 
 		 472 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  34.86 
 
 		 925 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  36.93 
 
 		 473 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  36.93 
 
 		 485 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  25.76 
 
 		 459 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  34.55 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  42.11 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  36.9 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  42.48 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  28.89 
 
 		 209 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  38.66 
 
 		 341 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  24.17 
 
 		 848 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  27.66 
 
 		 3392 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  48.72 
 
 		 330 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  43.44 
 
 		 332 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  45.83 
 
 		 333 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  45.83 
 
 		 333 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  19.08 
 
 		 1311 aa  53.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  19.08 
 
 		 1311 aa  53.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  43.55 
 
 		 334 aa  52.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  20 
 
 		 3242 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48676  predicted protein  24.58 
 
 		 4825 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2411  effector protein B, substrate of the Dot/Icm secretion system  21.04 
 
 		 1294 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  28.85 
 
 		 586 aa  50.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf497  massive surface protein MspF  15.42 
 
 		 2993 aa  49.7  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.378464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1331  hypothetical protein  23.08 
 
 		 247 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2206  hypothetical protein  28.18 
 
 		 228 aa  48.5  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 657 aa  48.5  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  23.84 
 
 		 1458 aa  47.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2555  effector protein B, substrate of the Dot/Icm secretion system  21.86 
 
 		 1294 aa  46.6  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.77 
 
 		 561 aa  45.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  32.72 
 
 		 9529 aa  44.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  26.21 
 
 		 958 aa  44.3  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  41.18 
 
 		 318 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>