140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3507 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 292 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  78.57 
 
 		 289 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  57.63 
 
 		 297 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  57.63 
 
 		 297 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  57.14 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  48.23 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  48.23 
 
 		 296 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  44.03 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  44.12 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  44.12 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  44.12 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  43.75 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  43.75 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  43.75 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  43.02 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  44.84 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  47.53 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  47.53 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  42.45 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  46.72 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  48.5 
 
 		 290 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  44.61 
 
 		 281 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  39.86 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  40.14 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  41.24 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  40.37 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  35.17 
 
 		 285 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  37.45 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  37.98 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  35.31 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  40.55 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  37.63 
 
 		 295 aa  168  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  38.41 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  38.14 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  38.52 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  37.82 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  37.64 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  35.79 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  38.04 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  34.67 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  36.23 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  36.23 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  35.76 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  38.58 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  34.66 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  34.48 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  34.3 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  33.08 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  34.14 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  33.1 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  34.55 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  35.41 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  35.41 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  32.76 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  34.19 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  32.49 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  32.13 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  31.99 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  31.16 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  30.48 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  31.46 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  29.51 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  28.3 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  28.3 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  28.36 
 
 		 344 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  27.82 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  28.29 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  27.21 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  28.29 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  27.89 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  28.47 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  28.29 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  28.2 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  27.89 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  27.89 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  27.98 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  26.09 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  27.02 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  28.98 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  27.44 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  28.05 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  28.69 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  25.83 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  30.58 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  25.43 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  27.39 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  25.31 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  27.13 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  27.92 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  28.33 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  25.2 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  25.41 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  24.6 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  27.46 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>