More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2121 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  93.33 
 
 		 282 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  82.9 
 
 		 270 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  82.9 
 
 		 270 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  82.96 
 
 		 274 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  79.1 
 
 		 269 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  81.11 
 
 		 270 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  80.74 
 
 		 270 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  80.37 
 
 		 270 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  79.32 
 
 		 275 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  76.16 
 
 		 281 aa  437  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  66.54 
 
 		 285 aa  364  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  59.39 
 
 		 286 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  60.98 
 
 		 292 aa  327  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  58.21 
 
 		 272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  60.46 
 
 		 292 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  60.94 
 
 		 261 aa  322  6e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  57.2 
 
 		 273 aa  319  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  57.2 
 
 		 273 aa  319  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  57.25 
 
 		 282 aa  318  7.999999999999999e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  57.25 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  58.58 
 
 		 270 aa  316  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  56.82 
 
 		 269 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  56.32 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 		 265 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 		 288 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 		 265 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 		 288 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 		 288 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 		 265 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 		 265 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  56.7 
 
 		 265 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  56.7 
 
 		 265 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  56.7 
 
 		 265 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  56.32 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  56.32 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  56.32 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  56.37 
 
 		 265 aa  305  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  54.79 
 
 		 281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  57.14 
 
 		 265 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  54.17 
 
 		 272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  57.31 
 
 		 264 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  54.41 
 
 		 281 aa  301  8.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  54.41 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  56.92 
 
 		 264 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.1 
 
 		 272 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  55.85 
 
 		 285 aa  298  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  54.31 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  53.93 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  53.01 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  52.43 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  52.85 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  50.2 
 
 		 288 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  44.36 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.42 
 
 		 292 aa  241  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.89 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.47 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.06 
 
 		 252 aa  228  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.44 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.99 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.28 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.57 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.18 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  46.03 
 
 		 280 aa  222  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  45.14 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  44.4 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  41.79 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  40.39 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.28 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  48.64 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  46.03 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.85 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  41.57 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  46.75 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.57 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.81 
 
 		 291 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  42.13 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  47.06 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  43.56 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  43.8 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  47.52 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  47.52 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  45.11 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  43.39 
 
 		 275 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.57 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.79 
 
 		 267 aa  211  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  47.52 
 
 		 252 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.75 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.79 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.9 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  43.12 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  47.03 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  40.38 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  44.16 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  42.64 
 
 		 282 aa  208  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2080  ABC transporter related  42.64 
 
 		 270 aa  208  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  41.9 
 
 		 432 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>