More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1172 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  69.48 
 
 		 174 aa  215  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  63.64 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  62 
 
 		 171 aa  190  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  75.21 
 
 		 176 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  75.21 
 
 		 176 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  75.21 
 
 		 176 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  61.33 
 
 		 190 aa  188  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  59.73 
 
 		 167 aa  187  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  66.41 
 
 		 165 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  64 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  67.94 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  60.4 
 
 		 166 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  70.94 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  61.07 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  61.74 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  61.33 
 
 		 171 aa  180  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  73.28 
 
 		 171 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  61.19 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  55.48 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  70.69 
 
 		 174 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 160 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  73.15 
 
 		 171 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  57.05 
 
 		 167 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  57.53 
 
 		 169 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  58 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  60.54 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  58.17 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  57.82 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  58.22 
 
 		 163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  62.73 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  64.15 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  55.63 
 
 		 168 aa  152  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  50.67 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  62.96 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  63.3 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  52.67 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  48.63 
 
 		 164 aa  147  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  62.96 
 
 		 137 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  56.8 
 
 		 168 aa  147  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 167 aa  146  9e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  57.76 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  59.09 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  56.14 
 
 		 138 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  56.14 
 
 		 138 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  60.36 
 
 		 135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  64.15 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  56.9 
 
 		 164 aa  143  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  58.49 
 
 		 164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  64.15 
 
 		 136 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  56.03 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 		 138 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  54.7 
 
 		 180 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 		 138 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  59.63 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  61.32 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  51.91 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  58.26 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  57.8 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  56.52 
 
 		 183 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  58.88 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  58.72 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  57.8 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  53.04 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  53.57 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 142 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  53.45 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  51.82 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  52.78 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  52.21 
 
 		 135 aa  127  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  53.1 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  52.78 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  52.59 
 
 		 141 aa  126  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  53.64 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  54.46 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  50.45 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  53.21 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  53.21 
 
 		 138 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  46.36 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  52.21 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  57.55 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  57.28 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  52.68 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  50.46 
 
 		 202 aa  124  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  50.85 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  53.57 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  57 
 
 		 229 aa  123  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  57.14 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  53.15 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  55.05 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  52.83 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  50.46 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  51.79 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  47.71 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  51.72 
 
 		 140 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>