238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0183 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  100 
 
 
290 aa  590  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  44.13 
 
 
305 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  45.55 
 
 
305 aa  244  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  44.13 
 
 
306 aa  242  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  43.42 
 
 
305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  43.06 
 
 
305 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  43.06 
 
 
305 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  43.06 
 
 
305 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  43.06 
 
 
305 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  43.06 
 
 
305 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  41.64 
 
 
305 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  42.7 
 
 
305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  42.7 
 
 
305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  42.7 
 
 
305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  40.14 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  41.64 
 
 
305 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  42.35 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  42.95 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  41.28 
 
 
307 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  43.97 
 
 
305 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  39.66 
 
 
306 aa  208  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  41.3 
 
 
302 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  43.21 
 
 
308 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  42.21 
 
 
307 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  42.5 
 
 
311 aa  205  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  40.93 
 
 
307 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  41.46 
 
 
317 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  43.66 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  41.02 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  40.7 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  39.93 
 
 
318 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  39.93 
 
 
318 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  39.93 
 
 
318 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  40.48 
 
 
317 aa  198  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  42.91 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  41.67 
 
 
329 aa  195  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  40 
 
 
309 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  39.36 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  39.08 
 
 
279 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  37.54 
 
 
310 aa  185  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  40.07 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  39.43 
 
 
308 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  41.46 
 
 
320 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  39.07 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  38.71 
 
 
306 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  37.72 
 
 
331 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  34.75 
 
 
333 aa  175  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  41.49 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  33.92 
 
 
333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  34.74 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  33.92 
 
 
333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  37.23 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  34.89 
 
 
279 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  37.28 
 
 
317 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  35.37 
 
 
306 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  33.11 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  39.79 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  30.85 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  33.45 
 
 
290 aa  145  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  35.56 
 
 
278 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  33.21 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  30.59 
 
 
271 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  31.14 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  28.91 
 
 
319 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  29.36 
 
 
996 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.72 
 
 
1001 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.57 
 
 
993 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.48 
 
 
1003 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.84 
 
 
1003 aa  99  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.79 
 
 
991 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.44 
 
 
1004 aa  95.9  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.57 
 
 
993 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.91 
 
 
1004 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.66 
 
 
1013 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 
1002 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.83 
 
 
1004 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.18 
 
 
991 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.18 
 
 
991 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  32.79 
 
 
360 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.55 
 
 
1001 aa  90.5  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.17 
 
 
1006 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  30.03 
 
 
975 aa  89.7  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29 
 
 
990 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  27.76 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1249  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.15 
 
 
1080 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.907532  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1138  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.21 
 
 
1085 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0641  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.33 
 
 
1046 aa  79.7  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.546222  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1249  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.87 
 
 
1063 aa  79.7  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1564  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 
1071 aa  79  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721596 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0744  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.01 
 
 
1046 aa  77.4  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001017  proline dehydrogenase (Proline oxidase)/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.38 
 
 
1043 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135188  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.71 
 
 
1221 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0714  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 
1059 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000141926  unclonable  0.0000000428455 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0375  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.74 
 
 
1049 aa  76.6  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.696802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3490  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.94 
 
 
1064 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000664694  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07096  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.25 
 
 
1043 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0398  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.62 
 
 
1041 aa  75.9  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0103  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.07 
 
 
1046 aa  75.1  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  29.35 
 
 
1191 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1427  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.58 
 
 
1240 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>