More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3195 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
394 aa  800    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 
421 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 
392 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
454 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 
460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 
444 aa  159  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 
426 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  40.94 
 
 
413 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
466 aa  145  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 
287 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 
312 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
924 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
309 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
313 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
313 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  30.49 
 
 
310 aa  86.7  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
513 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  27.74 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
528 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0217  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
477 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
717 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 
337 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
623 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
345 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
470 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
470 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
748 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
470 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.57 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  26.96 
 
 
754 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
717 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.89 
 
 
337 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
598 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
753 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
710 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.03 
 
 
1099 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6733  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
728 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
305 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  24.82 
 
 
752 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
321 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  23.79 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
617 aa  66.6  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2532  putative glycosyl transferase  29.17 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
344 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
344 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0844  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
281 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.649715  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
353 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
323 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
1359 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
312 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  27.65 
 
 
632 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  31.89 
 
 
642 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
273 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
305 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
301 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
308 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
362 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
299 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
632 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 
723 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
822 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 
1101 aa  63.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
305 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>