47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3157 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  62.24 
 
 		 98 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  56.25 
 
 		 98 aa  113  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  56.04 
 
 		 97 aa  97.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  38.95 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  37.89 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  39.36 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  38.54 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.42 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  40.91 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.46 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  31.11 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  30.21 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  32.43 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2332  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  29.47 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  26.6 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  29.47 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  32.43 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  24.49 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  28.87 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  35.16 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  34.88 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  25.53 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  29.9 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  27.84 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  29.17 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  25.81 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  23.96 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  25.53 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.63 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  33.66 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  31.25 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.59 
 
 		 97 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  36.17 
 
 		 96 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  36.08 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  26.8 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  33.7 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  31.76 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1389  plasmid stabilization system protein  35.05 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>