More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4089 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  100 
 
 
333 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  97.9 
 
 
333 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  85.29 
 
 
357 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  85.29 
 
 
334 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  77.18 
 
 
334 aa  541  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  77.78 
 
 
334 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2089  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  77.78 
 
 
360 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3943  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  77.04 
 
 
333 aa  531  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4126  glyoxylate reductase  72.04 
 
 
333 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0616  glycolate reductase  71.69 
 
 
333 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164009  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  72.95 
 
 
334 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  71.39 
 
 
333 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  72.64 
 
 
334 aa  484  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0217  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  71 
 
 
333 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.660632  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0073  putative glyoxylate reductase  70.69 
 
 
333 aa  484  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.692518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  73.17 
 
 
331 aa  484  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0511  glyoxylate reductase  70.82 
 
 
331 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  72.34 
 
 
334 aa  481  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0037  2-hydroxyacid dehydrogenase  71.9 
 
 
333 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  72.34 
 
 
334 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  72.34 
 
 
334 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0354  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  70.69 
 
 
333 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  71.21 
 
 
332 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0045  glycolate reductase  70.39 
 
 
333 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  69.18 
 
 
330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000307425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  66.26 
 
 
328 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  67.07 
 
 
328 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  60.98 
 
 
328 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  62.08 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0915  glycolate reductase  59.15 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1941  glyoxylate reductase  62.8 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  decreased coverage  0.00730231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2187  glyoxylate reductase  62.23 
 
 
328 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521168  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  59.76 
 
 
332 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0987  glyoxylate reductase  62.35 
 
 
328 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2313  2-hydroxyacid dehydrogenase  62.35 
 
 
328 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  58.05 
 
 
339 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4583  glyoxylate reductase  57.32 
 
 
332 aa  349  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1407  2-hydroxyacid dehydrogenase  47.55 
 
 
323 aa  286  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  48.12 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1815  glycolate reductase  46.79 
 
 
323 aa  275  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.802319  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2390  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.45 
 
 
324 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.129625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2807  glyoxylate reductase  47.09 
 
 
321 aa  272  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.949498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1872  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48.3 
 
 
319 aa  272  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3322  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.79 
 
 
323 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  45.03 
 
 
317 aa  270  4e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.25 
 
 
327 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  46.01 
 
 
274 aa  249  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  43.73 
 
 
339 aa  246  4e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.81 
 
 
338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000916966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.27 
 
 
318 aa  245  6e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.88 
 
 
326 aa  245  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  41.99 
 
 
334 aa  245  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  46.6 
 
 
327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.9 
 
 
329 aa  242  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.88 
 
 
323 aa  242  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1774  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.16 
 
 
328 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  48.16 
 
 
321 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.69 
 
 
326 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.69 
 
 
326 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  44.95 
 
 
316 aa  238  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  44.68 
 
 
327 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  43.07 
 
 
341 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.44 
 
 
320 aa  236  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5902  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic region:D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.88 
 
 
327 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0476763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2082  putative glyoxylate reductase  41.72 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.3 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1325  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.23 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  43.12 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3011  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.85 
 
 
315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  39.38 
 
 
320 aa  233  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000853458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  43.54 
 
 
340 aa  232  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5114  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.21 
 
 
323 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  40.74 
 
 
322 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2196  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.03 
 
 
316 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00601884  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.82 
 
 
326 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3366  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  45.54 
 
 
315 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.58 
 
 
332 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000514509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  40.19 
 
 
322 aa  228  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.61 
 
 
331 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  40.43 
 
 
322 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3326  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.8 
 
 
316 aa  227  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0625  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.2 
 
 
322 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  44.92 
 
 
324 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.44 
 
 
338 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5009  Glyoxylate reductase  45.77 
 
 
345 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  36.48 
 
 
319 aa  224  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1700  glyoxylate reductase  41.21 
 
 
329 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142261  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1622  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.24 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  41.1 
 
 
348 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2643  putative glycerate dehydrogenase  43.52 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2069  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.52 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  hitchhiker  0.00440451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  41.52 
 
 
330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  40.67 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  42.49 
 
 
331 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.24 
 
 
328 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.295585 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2926  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.91 
 
 
329 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2870  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  40.91 
 
 
352 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2784  glyoxylate reductase  40.91 
 
 
352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0203307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0513  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.91 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1821  glyoxylate reductase  40.91 
 
 
346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.011783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>