More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2082 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2082  putative glyoxylate reductase  100 
 
 
311 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  46.2 
 
 
330 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000307425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  44.52 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  45.91 
 
 
334 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  44.14 
 
 
331 aa  250  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  45.28 
 
 
334 aa  249  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0511  glyoxylate reductase  43.52 
 
 
331 aa  248  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2089  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  45.91 
 
 
360 aa  249  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  48.85 
 
 
274 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1815  glycolate reductase  40.56 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.802319  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.27 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  43.44 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  43.77 
 
 
332 aa  242  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  42.63 
 
 
328 aa  240  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  41.58 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3943  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.28 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.72 
 
 
334 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  42.59 
 
 
334 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  42.59 
 
 
334 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  41.54 
 
 
357 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.96 
 
 
334 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  41.67 
 
 
322 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  46.21 
 
 
324 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  42.59 
 
 
334 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  44.27 
 
 
327 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4126  glyoxylate reductase  42.46 
 
 
333 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  40.85 
 
 
341 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  44.14 
 
 
319 aa  235  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  41.72 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  44.98 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  42.15 
 
 
333 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  40.85 
 
 
340 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.44 
 
 
327 aa  232  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  41.36 
 
 
322 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  45.74 
 
 
319 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0073  putative glyoxylate reductase  42.95 
 
 
333 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.692518 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.2 
 
 
323 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  44.38 
 
 
321 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01500  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  43.21 
 
 
329 aa  229  6e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0616  glycolate reductase  42.95 
 
 
333 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164009  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0354  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.63 
 
 
333 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0915  glycolate reductase  39.6 
 
 
328 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  40.62 
 
 
334 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.01 
 
 
333 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0217  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.32 
 
 
333 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.660632  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  39.25 
 
 
327 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0045  glycolate reductase  42.32 
 
 
333 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.08 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  43.82 
 
 
331 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  39.62 
 
 
339 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  42.63 
 
 
318 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2807  glyoxylate reductase  41.21 
 
 
321 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.949498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2855  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.11 
 
 
345 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0987  glyoxylate reductase  46.3 
 
 
328 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2313  2-hydroxyacid dehydrogenase  43.93 
 
 
328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.69 
 
 
338 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000916966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4583  glyoxylate reductase  43.13 
 
 
332 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1941  glyoxylate reductase  42.12 
 
 
336 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  decreased coverage  0.00730231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0504  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.67 
 
 
322 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2281  2-hydroxyacid dehydrogenase  38.98 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882044  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  45.15 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0037  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.75 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3874  2-ketogluconate reductase  36.96 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  36.96 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03403  2-ketoaldonate reductase/glyoxylate reductase B  36.96 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03354  hypothetical protein  36.96 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4049  2-ketogluconate reductase  36.96 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3973  2-ketogluconate reductase  36.96 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1774  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.51 
 
 
328 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4929  2-ketogluconate reductase  36.96 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2187  glyoxylate reductase  44.04 
 
 
328 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521168  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.65 
 
 
326 aa  212  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.55 
 
 
326 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.08 
 
 
329 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501657  normal  0.548764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.55 
 
 
326 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0159  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  36.65 
 
 
324 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.27 
 
 
319 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  40.52 
 
 
322 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  41.99 
 
 
330 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3754  2-ketogluconate reductase  36.96 
 
 
324 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.27 
 
 
319 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  41.95 
 
 
319 aa  211  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0936  2-hydroxyacid dehydrogenase  44.72 
 
 
326 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0624  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.08 
 
 
329 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627467  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1103  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.08 
 
 
329 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341973  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01261  glyoxylate reductase  45.31 
 
 
357 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1062  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.08 
 
 
329 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558591  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1325  glycerate dehydrogenase  49.01 
 
 
323 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2784  glyoxylate reductase  39.58 
 
 
352 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0203307  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  39.58 
 
 
348 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1434  glycerate dehydrogenase  49.01 
 
 
323 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1506  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  49.01 
 
 
339 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0180022 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2498  glyoxylate reductase  41.92 
 
 
346 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1821  glyoxylate reductase  41.92 
 
 
346 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.011783  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2144  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.06 
 
 
327 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126393  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.49 
 
 
338 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0513  2-hydroxyacid dehydrogenase  41.92 
 
 
329 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.09 
 
 
323 aa  209  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2390  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.71 
 
 
324 aa  208  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.129625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>