More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2536 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  100 
 
 
318 aa  635    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  54.75 
 
 
319 aa  345  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  49.53 
 
 
322 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  50.31 
 
 
334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  49.06 
 
 
322 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  48.88 
 
 
315 aa  294  2e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  48.59 
 
 
316 aa  294  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  49.21 
 
 
324 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  47.32 
 
 
327 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  53.87 
 
 
327 aa  285  8e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  45.79 
 
 
317 aa  281  9e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  46.52 
 
 
339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5208  Glyoxylate reductase  53.61 
 
 
309 aa  272  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  49.22 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.02 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48.57 
 
 
329 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.51 
 
 
318 aa  263  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  45.85 
 
 
341 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  48.7 
 
 
274 aa  255  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0516  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  40.94 
 
 
323 aa  255  8e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.13 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  45.85 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.13 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.23 
 
 
326 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.27 
 
 
323 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.6 
 
 
327 aa  248  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.99 
 
 
338 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000916966  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  39.18 
 
 
322 aa  242  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2722  Glyoxylate reductase  47.63 
 
 
322 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0846  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.72 
 
 
326 aa  240  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.908652  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  44.38 
 
 
332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1983  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  51.75 
 
 
313 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275914  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26910  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  50.76 
 
 
329 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0278379  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.55 
 
 
331 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.63 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1815  glycolate reductase  46.73 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.802319  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01261  glyoxylate reductase  47.89 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2390  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.72 
 
 
324 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.129625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  45.48 
 
 
322 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  42.99 
 
 
330 aa  232  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000307425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  41.8 
 
 
328 aa  231  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2150  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.69 
 
 
328 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1980  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.45 
 
 
337 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177006  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.55 
 
 
332 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  46.1 
 
 
330 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2571  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  51.18 
 
 
321 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24433  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2977  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  49.62 
 
 
328 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269444  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  43.12 
 
 
339 aa  228  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  41.54 
 
 
328 aa  228  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  37.74 
 
 
320 aa  228  9e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000853458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35320  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  48.86 
 
 
328 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317653  normal  0.274973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2568  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  50 
 
 
320 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00217021  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4126  glyoxylate reductase  42.72 
 
 
333 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  40.43 
 
 
334 aa  225  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1407  2-hydroxyacid dehydrogenase  42.68 
 
 
323 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5009  Glyoxylate reductase  49.69 
 
 
345 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  40.87 
 
 
357 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3346  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.94 
 
 
316 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.025883  normal  0.0429345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  41.61 
 
 
334 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6779  Glyoxylate reductase  41.19 
 
 
327 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.93 
 
 
334 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  46.86 
 
 
348 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.99 
 
 
334 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  39.94 
 
 
328 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0273  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.17 
 
 
325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.443724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  37.14 
 
 
319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2298  2-ketogluconate reductase  46.02 
 
 
325 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3376  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  49.24 
 
 
320 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.555118  normal  0.118844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0511  glyoxylate reductase  41.12 
 
 
331 aa  222  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  42.99 
 
 
331 aa  222  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  41.61 
 
 
334 aa  222  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  41.61 
 
 
334 aa  222  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  40.3 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0915  glycolate reductase  39.63 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2382  gluconate 2-dehydrogenase  49.24 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54026  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  45.52 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.3 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  45.67 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  40.67 
 
 
333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  45.67 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2281  2-hydroxyacid dehydrogenase  41.69 
 
 
331 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882044  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  48.24 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3514  gluconate 2-dehydrogenase  40.25 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1700  glyoxylate reductase  41.23 
 
 
329 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5047  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  39.31 
 
 
330 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2082  putative glyoxylate reductase  42.63 
 
 
311 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4635  gluconate 2-dehydrogenase  39.31 
 
 
330 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0513  2-hydroxyacid dehydrogenase  46.18 
 
 
329 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1872  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.88 
 
 
319 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0217  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.37 
 
 
333 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.660632  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3943  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.23 
 
 
333 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0616  glycolate reductase  40.68 
 
 
333 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164009  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2784  glyoxylate reductase  46.18 
 
 
352 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0203307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.74 
 
 
335 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1821  glyoxylate reductase  46.18 
 
 
346 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.011783  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2002  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  44.94 
 
 
321 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2498  glyoxylate reductase  46.18 
 
 
346 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175353  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2048  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.94 
 
 
321 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1983  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.94 
 
 
321 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>