More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1484 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  92.88 
 
 		 337 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 337 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  67.36 
 
 		 344 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  65.88 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.88 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  62.39 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  57.01 
 
 		 339 aa  381  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  57.01 
 
 		 337 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.06 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.88 
 
 		 341 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.46 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  55.29 
 
 		 342 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.63 
 
 		 341 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  54.65 
 
 		 338 aa  346  4e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.98 
 
 		 341 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.43 
 
 		 342 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.93 
 
 		 339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.71 
 
 		 343 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.12 
 
 		 343 aa  331  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.33 
 
 		 351 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.22 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.74 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.81 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  48.33 
 
 		 328 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.5 
 
 		 334 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.04 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.1 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.84 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.32 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  48 
 
 		 355 aa  259  6e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.89 
 
 		 328 aa  248  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.67 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.62 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.28 
 
 		 308 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  50 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.65 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  49.31 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.85 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.57 
 
 		 353 aa  215  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.58 
 
 		 340 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.22 
 
 		 364 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.08 
 
 		 511 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.19 
 
 		 362 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  37.07 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  35.71 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.34 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  37.81 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.61 
 
 		 511 aa  165  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  35.84 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  39.62 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  35.91 
 
 		 349 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.62 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  32.83 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  32.83 
 
 		 341 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  32.83 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.16 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  37.94 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  32.83 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  32.83 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  32.83 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  33.53 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  34.16 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  32.83 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  38.49 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.83 
 
 		 341 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  32.52 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  32.63 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  35.6 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  33.81 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  35.53 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  32.9 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  36.02 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  36.18 
 
 		 342 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  33.63 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  36.03 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  35.94 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  36.18 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  37.63 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  33.88 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  35.44 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  35.34 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  35.34 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.59 
 
 		 353 aa  153  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  37.74 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  37.74 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  33.44 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  37.59 
 
 		 347 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  37.74 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  34.04 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  35.21 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>