More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0583 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  100 
 
 
224 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  92.38 
 
 
224 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  62.95 
 
 
226 aa  279  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  62.05 
 
 
226 aa  254  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  46.61 
 
 
224 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  47.73 
 
 
222 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  48.2 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  49.08 
 
 
226 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
224 aa  194  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  44.09 
 
 
226 aa  192  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  43.84 
 
 
226 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  42.2 
 
 
226 aa  189  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
243 aa  185  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  42.86 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  44.34 
 
 
232 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  44.34 
 
 
232 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  42.66 
 
 
227 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  42.08 
 
 
231 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  43.89 
 
 
232 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  42.86 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  43.6 
 
 
248 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  43.69 
 
 
246 aa  165  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  40.18 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  46.89 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.63 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  45.63 
 
 
245 aa  161  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  39.73 
 
 
230 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  38.39 
 
 
238 aa  153  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
228 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  39.37 
 
 
247 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  37.9 
 
 
246 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  38.7 
 
 
233 aa  141  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  44.23 
 
 
266 aa  141  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  38.36 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.15 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  40.8 
 
 
272 aa  138  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  41.79 
 
 
593 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.45 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  37.2 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  42.42 
 
 
276 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1474  ABC transporter related  39.27 
 
 
250 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  36.96 
 
 
288 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  37.67 
 
 
269 aa  128  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  36.41 
 
 
568 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.64 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.86 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.69 
 
 
641 aa  125  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 
257 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 
270 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  35.81 
 
 
280 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.11 
 
 
266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  39.13 
 
 
277 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  34.82 
 
 
273 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  36.87 
 
 
605 aa  125  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.15 
 
 
280 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 
253 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.2 
 
 
277 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.82 
 
 
256 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.23 
 
 
281 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.15 
 
 
280 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.38 
 
 
256 aa  124  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.21 
 
 
280 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
258 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 
280 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.62 
 
 
280 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3137  ABC transporter related  39.7 
 
 
277 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.62 
 
 
280 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  36.15 
 
 
568 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.02 
 
 
284 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  35.5 
 
 
281 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.62 
 
 
280 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20550  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.82 
 
 
253 aa  123  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  36.71 
 
 
242 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  31.94 
 
 
280 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  40 
 
 
214 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.5 
 
 
267 aa  122  3e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.62 
 
 
280 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  39.61 
 
 
221 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.62 
 
 
300 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.62 
 
 
300 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.62 
 
 
300 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.42 
 
 
244 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  32.38 
 
 
239 aa  122  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  34.36 
 
 
278 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.33 
 
 
398 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2126  ABC transporter related  42.54 
 
 
243 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0584803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  38.86 
 
 
271 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  32.86 
 
 
254 aa  121  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.51 
 
 
280 aa  121  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  36.76 
 
 
299 aa  121  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0714  ABC transporter related  37.5 
 
 
284 aa  121  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  36.97 
 
 
541 aa  121  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1700  ABC transporter related  36.68 
 
 
272 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  35.5 
 
 
282 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.63 
 
 
255 aa  121  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  33.8 
 
 
273 aa  121  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  33.8 
 
 
273 aa  121  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  32.89 
 
 
239 aa  121  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>