More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0150 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0156  ABC transporter related  96.13 
 
 
517 aa  1016    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000343593  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0150  ABC transporter related  100 
 
 
517 aa  1047    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995169  normal  0.0204884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3228  ABC transporter related  80.78 
 
 
517 aa  853    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.84 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  44.31 
 
 
507 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  44.11 
 
 
507 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 
507 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  44.22 
 
 
506 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.48 
 
 
495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43 
 
 
506 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  40.92 
 
 
525 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.89 
 
 
497 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  42.19 
 
 
495 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  40.24 
 
 
497 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  41.82 
 
 
515 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
498 aa  375  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  40.28 
 
 
500 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  40.94 
 
 
519 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  40.32 
 
 
537 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  40.98 
 
 
517 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.84 
 
 
501 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  41.43 
 
 
496 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.06 
 
 
503 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  40.29 
 
 
506 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.98 
 
 
499 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  41.02 
 
 
520 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 
494 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 
494 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.04 
 
 
496 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  40 
 
 
496 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  40.16 
 
 
505 aa  365  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
504 aa  364  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40.29 
 
 
494 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  40.52 
 
 
502 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  38.7 
 
 
500 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  41.02 
 
 
504 aa  363  4e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  41.26 
 
 
505 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  39.47 
 
 
524 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  40 
 
 
535 aa  362  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  41.41 
 
 
502 aa  362  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  40.94 
 
 
514 aa  362  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
494 aa  362  9e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  39.19 
 
 
516 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  40.73 
 
 
509 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  40.69 
 
 
503 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 
510 aa  359  6e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.96 
 
 
513 aa  359  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38.23 
 
 
517 aa  358  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 
516 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  38.87 
 
 
524 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  40.34 
 
 
524 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  38.87 
 
 
524 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  40.24 
 
 
501 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  40.77 
 
 
508 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.55 
 
 
512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  39.55 
 
 
512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  40.12 
 
 
514 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  39.31 
 
 
501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  40.12 
 
 
514 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  40.7 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  39.62 
 
 
510 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  40.34 
 
 
524 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40 
 
 
517 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  40.12 
 
 
514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  40.89 
 
 
507 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  39.31 
 
 
495 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  40.12 
 
 
516 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  39.23 
 
 
524 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  39.92 
 
 
501 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  37.45 
 
 
504 aa  355  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  39.88 
 
 
511 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  41.79 
 
 
522 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  39.14 
 
 
492 aa  355  1e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  39.88 
 
 
501 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  38.75 
 
 
522 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  36.68 
 
 
493 aa  355  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  38.9 
 
 
501 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  40.64 
 
 
494 aa  354  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  40.2 
 
 
512 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  41.21 
 
 
503 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  40.2 
 
 
512 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  38.98 
 
 
499 aa  354  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  38.96 
 
 
520 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  41.56 
 
 
511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  39.02 
 
 
503 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  39.06 
 
 
501 aa  353  4e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 
519 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  38.96 
 
 
509 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  39.14 
 
 
494 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.85 
 
 
527 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
522 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  39.71 
 
 
501 aa  352  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  40.97 
 
 
501 aa  351  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  39.03 
 
 
524 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  39.76 
 
 
517 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>