148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4155 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 266 aa  551  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  74.24 
 
 		 291 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  57.03 
 
 		 267 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  56.64 
 
 		 267 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  56.64 
 
 		 285 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  56.64 
 
 		 267 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  56.64 
 
 		 267 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  56.64 
 
 		 267 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  56.32 
 
 		 270 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  56.25 
 
 		 288 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  56.47 
 
 		 344 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  56.64 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  56.08 
 
 		 270 aa  285  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  53.7 
 
 		 270 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  54.41 
 
 		 274 aa  278  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  54.09 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  51.75 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  52.69 
 
 		 267 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  51.52 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  54.41 
 
 		 269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  53.05 
 
 		 266 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  53.05 
 
 		 266 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  52.53 
 
 		 265 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  52.67 
 
 		 271 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  52.14 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  54.3 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  52.31 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  54.41 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  53.12 
 
 		 287 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  54.69 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  51.36 
 
 		 265 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  51.36 
 
 		 265 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  52.14 
 
 		 266 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  50.97 
 
 		 265 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  51.52 
 
 		 266 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  50.58 
 
 		 265 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  53.28 
 
 		 267 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  51.43 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  51.84 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  52.59 
 
 		 266 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  55.6 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  48.83 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 		 267 aa  245  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  48.66 
 
 		 274 aa  241  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  46.72 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  48.09 
 
 		 266 aa  238  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  49.6 
 
 		 266 aa  235  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  47.33 
 
 		 277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  45.38 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  44.88 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  44.98 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  47.08 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  47.08 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  47.47 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  44.49 
 
 		 262 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  47.04 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  43.53 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  46.01 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  46.33 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  44.53 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  43.94 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  45.75 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  41.8 
 
 		 271 aa  211  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  41.67 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  49.11 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  42.42 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  40.93 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  41.57 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  43.33 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  42.08 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  33.47 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  32.35 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  27.9 
 
 		 310 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  31.8 
 
 		 296 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7802  N-formylglutamate amidohydrolase  32.74 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  29.96 
 
 		 286 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  34.13 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  30.71 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  30.93 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  30.58 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  30.94 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  29.6 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  30.67 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  30.38 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  30.25 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  29.72 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  30.29 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  31.33 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  29.54 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  27.02 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  29.54 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  31.13 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  28.88 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  30.28 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  29.32 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  25.79 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  32.08 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  28.03 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>