More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1025 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  65.41 
 
 		 480 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  75.74 
 
 		 480 aa  731    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  77.52 
 
 		 485 aa  744    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  73.9 
 
 		 482 aa  691    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  65.4 
 
 		 481 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  69.13 
 
 		 479 aa  641    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  73.89 
 
 		 479 aa  733    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  77.31 
 
 		 485 aa  742    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  99.58 
 
 		 480 aa  973    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 480 aa  979    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  79.54 
 
 		 482 aa  772    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  67.86 
 
 		 479 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  65.47 
 
 		 480 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  77.68 
 
 		 478 aa  754    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  85.86 
 
 		 479 aa  843    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  63.52 
 
 		 480 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  64.63 
 
 		 479 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  63.24 
 
 		 498 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  65.25 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  63.35 
 
 		 477 aa  609  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  62.92 
 
 		 477 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  62.92 
 
 		 477 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  61.44 
 
 		 477 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  61.57 
 
 		 475 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  61.02 
 
 		 477 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  62 
 
 		 482 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  60.71 
 
 		 477 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  59.24 
 
 		 478 aa  578  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  57.87 
 
 		 476 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  64.85 
 
 		 446 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  56.69 
 
 		 480 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  57.75 
 
 		 480 aa  564  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  56.69 
 
 		 480 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  56.09 
 
 		 483 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  53.29 
 
 		 483 aa  518  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  51.92 
 
 		 486 aa  503  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  51.89 
 
 		 486 aa  502  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  53.05 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  51.26 
 
 		 482 aa  500  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  51.05 
 
 		 486 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  51.71 
 
 		 491 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  53.5 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  50.64 
 
 		 487 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  51.39 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  50.43 
 
 		 482 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  63.53 
 
 		 441 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  50.42 
 
 		 482 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  45.3 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  45.03 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  43.04 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  39.92 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 		 497 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  40.67 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 498 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  42.38 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  42.8 
 
 		 493 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  44.75 
 
 		 493 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.39 
 
 		 496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  39.12 
 
 		 505 aa  356  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  45.41 
 
 		 474 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  40.99 
 
 		 500 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  39.29 
 
 		 496 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  40.92 
 
 		 482 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  40.97 
 
 		 482 aa  345  1e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 		 481 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 488 aa  339  8e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  41.82 
 
 		 516 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  39.35 
 
 		 485 aa  336  5e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  38.96 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 491 aa  333  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  37.92 
 
 		 478 aa  332  7.000000000000001e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  38.72 
 
 		 484 aa  331  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  39.34 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 		 498 aa  327  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  45.03 
 
 		 497 aa  324  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  42.12 
 
 		 505 aa  322  6e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  38.05 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  38.14 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  39.5 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 		 490 aa  309  8e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.03 
 
 		 498 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  36.93 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  40.35 
 
 		 468 aa  305  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  37.08 
 
 		 501 aa  303  6.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5826  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.79 
 
 		 485 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26319  normal  0.439131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2030  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase (HpaE)  38.41 
 
 		 485 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0934174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.53 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  36.59 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.21 
 
 		 486 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07430  hypothetical protein  35.74 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.782737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 		 483 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  40.04 
 
 		 478 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.03 
 
 		 508 aa  299  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 		 496 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  36.68 
 
 		 488 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  39.02 
 
 		 488 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>