63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6244 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6244  hypothetical protein  100 
 
 		 650 aa  1323    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1495  integrase catalytic region  40.56 
 
 		 657 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170756 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  38.85 
 
 		 662 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  39.91 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0284  hypothetical protein  29.64 
 
 		 659 aa  299  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0178  hypothetical protein  29.64 
 
 		 659 aa  299  9e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00166978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1315  hypothetical protein  29.93 
 
 		 659 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0292407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2056  hypothetical protein  28.26 
 
 		 675 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12326  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4630  hypothetical protein  29.42 
 
 		 678 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2253  hypothetical protein  25.08 
 
 		 635 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000796594  normal  0.115839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00554  hypothetical protein  27.63 
 
 		 630 aa  174  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5261  hypothetical protein  28 
 
 		 675 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.897267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5598  hypothetical protein  28 
 
 		 675 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6589  hypothetical protein  30.94 
 
 		 444 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  27.88 
 
 		 721 aa  70.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  26.29 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  27.98 
 
 		 709 aa  63.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  24.69 
 
 		 616 aa  61.6  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  25.59 
 
 		 618 aa  60.1  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1249  hypothetical protein  27.08 
 
 		 313 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  25.57 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  26.15 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  27.22 
 
 		 617 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  25.74 
 
 		 782 aa  54.3  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 556 aa  54.3  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 556 aa  54.3  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 556 aa  54.3  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 617 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 556 aa  54.3  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  24.37 
 
 		 740 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  28.32 
 
 		 552 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  25.12 
 
 		 791 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  27.01 
 
 		 754 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  24.75 
 
 		 542 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  26.79 
 
 		 422 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  23.83 
 
 		 536 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  25.94 
 
 		 560 aa  50.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  25.65 
 
 		 704 aa  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  25.35 
 
 		 634 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  27.49 
 
 		 509 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  25.35 
 
 		 634 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  27.48 
 
 		 599 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  27.49 
 
 		 572 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  27.49 
 
 		 562 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  27.48 
 
 		 599 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  21.96 
 
 		 581 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  29.01 
 
 		 718 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  26.88 
 
 		 487 aa  48.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  24.15 
 
 		 774 aa  47.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0150  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  47.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.865216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  22.7 
 
 		 651 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  22.41 
 
 		 560 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  32.08 
 
 		 749 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  23.67 
 
 		 829 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  30.6 
 
 		 738 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  24.33 
 
 		 541 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  24.33 
 
 		 541 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  24.33 
 
 		 541 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  24.33 
 
 		 541 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  29.89 
 
 		 738 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  23.59 
 
 		 644 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  24.26 
 
 		 632 aa  44.3  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  26.52 
 
 		 539 aa  44.3  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>