More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5195 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.06 
 
 
696 aa  883    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.43 
 
 
666 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.43 
 
 
666 aa  682    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.73 
 
 
635 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  71.99 
 
 
646 aa  917    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  65.1 
 
 
635 aa  806    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  100 
 
 
627 aa  1261    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  59.27 
 
 
917 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.06 
 
 
714 aa  884    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.1 
 
 
676 aa  688    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  60.36 
 
 
692 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.54 
 
 
658 aa  693    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.31 
 
 
655 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.61 
 
 
663 aa  858    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.94 
 
 
635 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.53 
 
 
662 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.41 
 
 
635 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  58.76 
 
 
659 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.43 
 
 
852 aa  681    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.03 
 
 
653 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.37 
 
 
658 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.43 
 
 
666 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.6 
 
 
666 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.6 
 
 
666 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.31 
 
 
655 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.37 
 
 
658 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.95 
 
 
647 aa  699    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.3 
 
 
607 aa  665    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.61 
 
 
663 aa  858    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.44 
 
 
610 aa  620  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.36 
 
 
687 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.94 
 
 
610 aa  608  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.52 
 
 
623 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.44 
 
 
697 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  53.47 
 
 
615 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  51.79 
 
 
630 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.47 
 
 
646 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.55 
 
 
645 aa  599  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.47 
 
 
646 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.09 
 
 
706 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  53.31 
 
 
645 aa  596  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  53.18 
 
 
702 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.34 
 
 
705 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.31 
 
 
618 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.31 
 
 
618 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
694 aa  586  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  50.64 
 
 
621 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.63 
 
 
699 aa  586  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.49 
 
 
633 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.03 
 
 
605 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  50.48 
 
 
699 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.11 
 
 
686 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  51.86 
 
 
605 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  52.18 
 
 
616 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  50.08 
 
 
694 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.62 
 
 
623 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  49.2 
 
 
706 aa  580  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 
645 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.68 
 
 
630 aa  581  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.37 
 
 
624 aa  581  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  50.64 
 
 
627 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.04 
 
 
618 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 
616 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.54 
 
 
617 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.89 
 
 
697 aa  572  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.13 
 
 
615 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.81 
 
 
610 aa  566  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  50.24 
 
 
618 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
607 aa  565  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.65 
 
 
610 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
714 aa  561  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.49 
 
 
625 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.07 
 
 
717 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.23 
 
 
713 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  47.88 
 
 
614 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.99 
 
 
696 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  52.81 
 
 
621 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  46.33 
 
 
691 aa  553  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  53.1 
 
 
624 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  53.99 
 
 
623 aa  554  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0723  FtsH-2 peptidase  50.8 
 
 
609 aa  554  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0513277  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.53 
 
 
602 aa  554  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  53.93 
 
 
619 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.05 
 
 
630 aa  550  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.06 
 
 
631 aa  550  1e-155  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.131641 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  52.85 
 
 
620 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.91 
 
 
637 aa  548  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  46.19 
 
 
641 aa  547  1e-154  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.6 
 
 
615 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  49.35 
 
 
625 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  51.29 
 
 
617 aa  547  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1259  cell division protein FtsH  46.46 
 
 
645 aa  542  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.87 
 
 
612 aa  542  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  45.96 
 
 
648 aa  542  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  53.93 
 
 
629 aa  544  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.86 
 
 
667 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  47.03 
 
 
608 aa  545  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  54.62 
 
 
692 aa  542  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1134  cell division protein FtsH  46.46 
 
 
645 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  47.27 
 
 
658 aa  541  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>