214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3842 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7177  hypothetical protein  89.14 
 
 		 350 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2044  hypothetical protein  88.37 
 
 		 351 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2143  hypothetical protein  94.87 
 
 		 352 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3842  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  733    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1441  hypothetical protein  88.37 
 
 		 351 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1731  hypothetical protein  91.74 
 
 		 352 aa  685    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2334  hypothetical protein  88.37 
 
 		 351 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6358  hypothetical protein  89.74 
 
 		 351 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2174  hypothetical protein  87.43 
 
 		 352 aa  645    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1067  hypothetical protein  88.37 
 
 		 351 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3101  hypothetical protein  88.37 
 
 		 351 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1352  hypothetical protein  88.37 
 
 		 351 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2818  hypothetical protein  85.96 
 
 		 350 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2675  hypothetical protein  85.67 
 
 		 350 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4842  hypothetical protein  78.63 
 
 		 351 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174073  normal  0.0113418 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1606  hypothetical protein  77.78 
 
 		 351 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522694  normal  0.309997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1587  hypothetical protein  77.78 
 
 		 351 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0020  hypothetical protein  68.51 
 
 		 354 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5120  hypothetical protein  67.93 
 
 		 353 aa  494  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5051  hypothetical protein  64.64 
 
 		 352 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3954  protein of unknown function DUF849  63.14 
 
 		 349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2011  hypothetical protein  65.6 
 
 		 352 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3841  protein of unknown function DUF849  63.14 
 
 		 349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.839397  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3902  hypothetical protein  65.01 
 
 		 352 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2007  hypothetical protein  64.2 
 
 		 352 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4631  hypothetical protein  63.56 
 
 		 352 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00375175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5079  hypothetical protein  62.78 
 
 		 352 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4715  hypothetical protein  63.25 
 
 		 351 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155352  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5286  hypothetical protein  60.93 
 
 		 355 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1597  hypothetical protein  60.35 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  28.06 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  27.36 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  26.06 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  26.86 
 
 		 272 aa  93.2  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  27.51 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  26.22 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  24.92 
 
 		 293 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  26.56 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  24.3 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.57 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  26.57 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  24.6 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.02 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  24.36 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  26.45 
 
 		 272 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  24.68 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  23.02 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  24.92 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  23.89 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  25 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  25.85 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  27.36 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  26.16 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  23.27 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  22.33 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  22.76 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.73 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  25.16 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  24.13 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  25.48 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.62 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  25.16 
 
 		 274 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  22.22 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  24.76 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  25.16 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  24.28 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  25.48 
 
 		 272 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  26.98 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.16 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  25.17 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  22.97 
 
 		 297 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  26.52 
 
 		 288 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  25.16 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  25.63 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  25.32 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  25.63 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  25.16 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  22.86 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  23.23 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  23.17 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  25.16 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  23.62 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  26.75 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  27.07 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  22.78 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  25.32 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  25.51 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  23.23 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  25.54 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  23.79 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  23.64 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  24.23 
 
 		 294 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  23.53 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  23.42 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  25.88 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  23.42 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  23.45 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  24.26 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2814  hypothetical protein  24.84 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  23.55 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>