201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2852 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  594  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  85.37 
 
 		 294 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.12 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  48.42 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  51.3 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.82 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0825  hypothetical protein  49.46 
 
 		 283 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4618  hypothetical protein  48.72 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  29.75 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  29.14 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.92 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  27.96 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  29.09 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  28.78 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  27 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  29.21 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  29.89 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  29.54 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  28.12 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  29.54 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  29.54 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  29.54 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  29.54 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  29.54 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.26 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  27.7 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  29.28 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  30.07 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  30.39 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  30.39 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  30.57 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  24.33 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2654  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.19 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  27.84 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  27.84 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  27.84 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  25.93 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  27.84 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  27.16 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  28.09 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  27.49 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  27.1 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  27.71 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  27.51 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  27.51 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  26.84 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  25.09 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  24.55 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  27.14 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.69 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  26.69 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  26.69 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  26.69 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  26.69 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  26.14 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  27.53 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.71 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  24.38 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  27.24 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.69 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.9 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  31.02 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  31.02 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  23.83 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  30.92 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.31 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 		 340 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  26.78 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.44 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2363  hypothetical protein  28.3 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.847183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  28.71 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  25.27 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.37 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.52 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.2 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.52 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  25.95 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.85 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.85 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  23.83 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  26.58 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  27.19 
 
 		 494 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  22.96 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  27.45 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.39 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.34 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.85 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  22.81 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>