More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1802 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 
413 aa  840    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  69.67 
 
 
395 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  47.86 
 
 
403 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  46.37 
 
 
404 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  46.63 
 
 
406 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  41.33 
 
 
401 aa  326  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  44.39 
 
 
402 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  43.89 
 
 
402 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  43.1 
 
 
404 aa  324  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  43.53 
 
 
403 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  42.42 
 
 
414 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  42 
 
 
395 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  42.93 
 
 
427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  40.33 
 
 
419 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  39.05 
 
 
413 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  40.66 
 
 
410 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  39.22 
 
 
409 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  39.56 
 
 
419 aa  296  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  39.07 
 
 
431 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  40.65 
 
 
393 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  37.81 
 
 
411 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  39.75 
 
 
446 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 
399 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  36.6 
 
 
419 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  41.69 
 
 
372 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 
400 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  34.03 
 
 
377 aa  227  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 
406 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
304 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 
402 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
429 aa  202  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  33.42 
 
 
412 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 
411 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 
411 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  29.51 
 
 
424 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 
439 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 
388 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 
396 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
396 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 
396 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 
401 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
398 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  30.79 
 
 
436 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 
396 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
404 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  28.92 
 
 
394 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  29.16 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 
397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 
390 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  28.12 
 
 
392 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 
386 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
400 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 
394 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 
448 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
401 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  27.66 
 
 
405 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 
398 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  27.03 
 
 
403 aa  176  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 
400 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 
401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  26.39 
 
 
389 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  27.84 
 
 
410 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 
319 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  28.39 
 
 
395 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 
391 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  29.04 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 
395 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  27.4 
 
 
390 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  34.82 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  27.64 
 
 
388 aa  152  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 
350 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 
364 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 
373 aa  150  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  30.15 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 
349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  28.62 
 
 
379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 
350 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  26.95 
 
 
420 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  26.95 
 
 
420 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  32.33 
 
 
366 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  30.33 
 
 
443 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  26.6 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  29.34 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
431 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  27.64 
 
 
369 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 
419 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 
370 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 
420 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  25.5 
 
 
377 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  27.79 
 
 
446 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  25.77 
 
 
417 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>