More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1688 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  80.61 
 
 		 291 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  62.41 
 
 		 290 aa  346  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  62.2 
 
 		 290 aa  346  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3716  LysR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 290 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.294124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  58.56 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 303 aa  310  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 313 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  49.48 
 
 		 306 aa  271  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 326 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 326 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 326 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  48.1 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  48.8 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  50.54 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  50.54 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  50.54 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  50.54 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  50.54 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  48.45 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 		 303 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  48.8 
 
 		 307 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  50.54 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 295 aa  258  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  49.12 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  49.12 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  49.12 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  49.12 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  49.12 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  49.12 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  49.12 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  49.29 
 
 		 295 aa  248  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1173  LysR family transcriptional regulator  47 
 
 		 319 aa  245  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  48.93 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  48.93 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  48.93 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 298 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2367  transcriptional regulator, LysR family  50.36 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  47.12 
 
 		 296 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  47.12 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  44.27 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  40.29 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  40.29 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  39.93 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  39.93 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  39.93 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  39.93 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  39.93 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  40.28 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 		 298 aa  195  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.36 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  42.21 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 296 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 295 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1108  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 337 aa  170  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.102258 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  35.49 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  39.69 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 294 aa  169  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>