More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1478 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  71.34 
 
 
477 aa  699    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  65.19 
 
 
480 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  71.76 
 
 
477 aa  704    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  65.42 
 
 
479 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  68.12 
 
 
485 aa  650    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  68.76 
 
 
478 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  70.71 
 
 
477 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  68.41 
 
 
485 aa  652    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  73.22 
 
 
498 aa  712    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
481 aa  984    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  74.18 
 
 
446 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  66.95 
 
 
479 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  70.48 
 
 
479 aa  671    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  74.38 
 
 
482 aa  730    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  66.11 
 
 
482 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  67.98 
 
 
479 aa  663    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  66.24 
 
 
480 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  69.44 
 
 
479 aa  670    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  68.2 
 
 
475 aa  660    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  72.38 
 
 
477 aa  707    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  70.92 
 
 
477 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  64.98 
 
 
480 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  65.61 
 
 
480 aa  628  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  65.4 
 
 
480 aa  627  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  66.39 
 
 
482 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  64.94 
 
 
480 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  61.64 
 
 
477 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  58.53 
 
 
480 aa  581  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  57.86 
 
 
478 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  61.01 
 
 
482 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  58.19 
 
 
480 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
476 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  58.19 
 
 
480 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  56.87 
 
 
483 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  55 
 
 
483 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  54.99 
 
 
486 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  54.78 
 
 
486 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  53.83 
 
 
486 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  54.51 
 
 
491 aa  511  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  53.62 
 
 
487 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  52.81 
 
 
482 aa  508  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  54.68 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  64.89 
 
 
441 aa  488  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  52.6 
 
 
478 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  52.01 
 
 
482 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  50.82 
 
 
484 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  48.73 
 
 
482 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  45.49 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  42.62 
 
 
493 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  45.77 
 
 
483 aa  391  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  42.59 
 
 
497 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 
503 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  41.54 
 
 
505 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  43.37 
 
 
479 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  43.36 
 
 
485 aa  369  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  42.53 
 
 
498 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 
499 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  42.15 
 
 
500 aa  365  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
498 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  38.28 
 
 
496 aa  361  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  42.47 
 
 
516 aa  360  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 
483 aa  358  9e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  39.3 
 
 
478 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  44.52 
 
 
474 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
498 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  41.09 
 
 
493 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
485 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  42.65 
 
 
482 aa  348  9e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  41.12 
 
 
482 aa  347  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  42.02 
 
 
493 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  40.13 
 
 
496 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 
481 aa  339  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
496 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  43.58 
 
 
488 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  40.69 
 
 
491 aa  326  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 
506 aa  325  9e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.65 
 
 
490 aa  324  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
491 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  37.19 
 
 
484 aa  319  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  38.62 
 
 
490 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  38.81 
 
 
494 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  42.65 
 
 
497 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.45 
 
 
507 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
490 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
489 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  37.11 
 
 
497 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.57 
 
 
475 aa  315  9e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  39.62 
 
 
497 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 
489 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  38.48 
 
 
491 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5826  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.32 
 
 
485 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26319  normal  0.439131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  43.42 
 
 
505 aa  312  7.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  36.51 
 
 
496 aa  311  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.08 
 
 
479 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  41.79 
 
 
483 aa  310  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  37.97 
 
 
490 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 
483 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.66 
 
 
479 aa  309  8e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2030  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase (HpaE)  38.53 
 
 
485 aa  309  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0934174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>