More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3264 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3264  methyltransferase type 11  100 
 
 		 237 aa  460  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1986  methyltransferase type 11  57.14 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  30.27 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  31.33 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1107  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000024233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  29.55 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  32.09 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  34.03 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 352 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  30.91 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  33.93 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0166  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.21 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3682  hypothetical protein  26.92 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000635868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  27.27 
 
 		 322 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  27.27 
 
 		 322 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 		 711 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  27.27 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  33 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  27.07 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.57 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3036  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.91 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.68 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  27.07 
 
 		 315 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  27 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1295  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.65 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 293 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 271 aa  52  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  38.18 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.73 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.46 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1588  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.666171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 710 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.17 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.45 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0952  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  40.87 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2861  methyltransferase type 12  32.65 
 
 		 508 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  37.27 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  33.33 
 
 		 629 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1468  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.86 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  36 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.78 
 
 		 277 aa  48.9  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  20.81 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  37.82 
 
 		 276 aa  48.9  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 271 aa  48.5  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 260 aa  48.5  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.85 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.31 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.71 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>