More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1986 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1986  methyltransferase type 11  100 
 
 		 238 aa  467  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3264  methyltransferase type 11  57.14 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1107  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000024233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  37.17 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  36 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  35.83 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  34.4 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  29.77 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  38.52 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  35.09 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 1106 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  33.93 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  43.36 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1338  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 182 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 		 711 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 315 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 710 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  23.72 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  34.71 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  38 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.95 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 280 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0529  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 268 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.636084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 182 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 216 aa  52.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.03 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  30.61 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.92 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  32.48 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  22.62 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  26.92 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  22.88 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  35.71 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  31.4 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3682  hypothetical protein  26.92 
 
 		 315 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000635868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  34.45 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  26.92 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  40.23 
 
 		 290 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 457 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2169  methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.92 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 293 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1587  SAM-dependent methyltransferase  28.32 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 		 1032 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  22.16 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 257 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.6 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.48 
 
 		 503 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  34.91 
 
 		 253 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  37.39 
 
 		 274 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>