152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0933 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  701    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  98.92 
 
 		 370 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  94.05 
 
 		 370 aa  627  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  53.49 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  55.05 
 
 		 386 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  52.4 
 
 		 367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  49.09 
 
 		 367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  29.48 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  32.25 
 
 		 440 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  30.08 
 
 		 466 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  29.81 
 
 		 458 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  30.08 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  30.68 
 
 		 430 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  29.27 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  28.7 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  29.26 
 
 		 478 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  30.84 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  29.43 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  28.69 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  29.24 
 
 		 477 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  27.95 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  27.2 
 
 		 446 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  29.31 
 
 		 449 aa  113  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  29.31 
 
 		 449 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  28.57 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  30.43 
 
 		 465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  26 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  27.95 
 
 		 459 aa  109  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  27.2 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  29.28 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  27.66 
 
 		 461 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  24.93 
 
 		 420 aa  102  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  36.08 
 
 		 467 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  35.76 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  28.21 
 
 		 350 aa  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  33.56 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  26.42 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  26.5 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  28.9 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  21.61 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  22.76 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  33.86 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  31.97 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  21.36 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  24.42 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  31.41 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  29.01 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  34.48 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  31.39 
 
 		 411 aa  67  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  31.69 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  31.69 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  37.27 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  28.4 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  31.69 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  33.79 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  21.95 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  22.7 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  26.24 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  31.29 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  27.97 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  33.79 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  33.79 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  28.47 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  28.48 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  27.54 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  29.25 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  26.14 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  33.59 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  30.66 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  27.67 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  26.32 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  26.81 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  29.73 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  28.97 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  31.97 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  26.21 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  24.5 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  25.48 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  27.63 
 
 		 477 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  26.16 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  29.69 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  20.81 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  20.5 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  27.83 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  20.81 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  30.22 
 
 		 472 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  20.81 
 
 		 362 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  29.82 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  26.63 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  30.22 
 
 		 472 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  28.8 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  27.01 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  27.01 
 
 		 411 aa  53.1  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  27.4 
 
 		 369 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  29.41 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  21.43 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  28.78 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  27.4 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  28.78 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>