247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4888 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4888  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 331 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0561  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0889  glycosyl transferase family protein  39.14 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0302002  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.03 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  24.48 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.34 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  24.13 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.64 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.45 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  25.45 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.68 
 
 		 358 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  24.19 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  31.12 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.75 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0678  glycosyl transferase family 9  36.84 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.94 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  28.76 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.07 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.45 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.17 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.4 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0879  glycosyl transferase family 9  22.78 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000737815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  24 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  24.69 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.3 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.19 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  26.39 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0682  hypothetical protein  24.03 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3478  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.41 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.74 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  21 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1430  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.85 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.19 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.81 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.25 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.47 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.47 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  24.73 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.1 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.47 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.47 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.63 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.19 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.19 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  22.06 
 
 		 344 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  29.25 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  24.57 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  27.15 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  33.93 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  33.93 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.27 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  37.74 
 
 		 622 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  27.14 
 
 		 574 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  37.74 
 
 		 622 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  37.74 
 
 		 625 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 		 400 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.3 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  37.74 
 
 		 643 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  37.74 
 
 		 622 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  21.94 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  22.95 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  30.37 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.76 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  37.74 
 
 		 628 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  37.74 
 
 		 625 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  27.15 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.49 
 
 		 390 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.83 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  32.41 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2604  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.4 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00142989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  26.17 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  26.39 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.71 
 
 		 458 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>