286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2623 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2623  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 		 334 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  70.27 
 
 		 336 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  71.56 
 
 		 335 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  73.13 
 
 		 335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1502  allophanate hydrolase subunit 2  68.86 
 
 		 339 aa  448  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  68.96 
 
 		 349 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  66.87 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  48.07 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  47.63 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  47.75 
 
 		 344 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1708  urea amidolyase related protein  45.97 
 
 		 339 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1495  urea amidolyase related protein  45.79 
 
 		 344 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0419081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  45.04 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  40.21 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  41.25 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  41.53 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  41.58 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1505  allophanate hydrolase subunit 2  42.41 
 
 		 353 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  41.35 
 
 		 353 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  39.42 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  39.42 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  39.19 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3431  urea amidolyase related protein  43.81 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  39.81 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  42.96 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  35.99 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  40.06 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  38.04 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  40.41 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1714  hypothetical protein  34.98 
 
 		 321 aa  179  8e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  38.34 
 
 		 355 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  38.34 
 
 		 355 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  38.34 
 
 		 355 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1528  hypothetical protein  34.98 
 
 		 321 aa  179  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3354  urea amidolyase related protein  43.49 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  39.14 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  36.39 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  38.96 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  38.31 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  34.32 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  38.96 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  38.96 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3142  urea amidolyase related protein  40.47 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  39.61 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  39.29 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  39.61 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  39.61 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  39.61 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  39.6 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  38.66 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  36.81 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  38.11 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.11 
 
 		 310 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  38.11 
 
 		 310 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  38.11 
 
 		 310 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  38.44 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  34.59 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  35.47 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  35.1 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  38.91 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.14 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.14 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  36.99 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  37.14 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.14 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.14 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  38.28 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  36.83 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  35.47 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  38.69 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  36.83 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  35.12 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  36.08 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  36.83 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  38.36 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  39.18 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  37.46 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  37.87 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  34.63 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  38.41 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  33.66 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.75 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  32.11 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  36.19 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  37.46 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  37.18 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0520  urea amidolyase related protein  40.24 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.41 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  32.67 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  33.98 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  33.33 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  33.98 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1384  urea amidolyase related protein  37.79 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.669414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  38.78 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  33.66 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  40.33 
 
 		 536 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  37 
 
 		 310 aa  162  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  37.11 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  40.7 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2804  allophanate hydrolase subunit 2  37.85 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.776372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>