56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0665 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  100 
 
 		 436 aa  855    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  33.58 
 
 		 443 aa  206  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  32.84 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  38.68 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  31.9 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  32.76 
 
 		 358 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  30.26 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  29.81 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  33.47 
 
 		 433 aa  92.8  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  27.55 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  28.52 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  29.79 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  30.23 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  28.78 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  30.32 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  30.23 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  29.36 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  24.39 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  28.85 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  25.76 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  28 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  28.21 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  21.81 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  25.59 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  28.21 
 
 		 512 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  31.43 
 
 		 451 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  29.15 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  29.15 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  34.15 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  30 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  35 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  32.5 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  31.76 
 
 		 460 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  32.93 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  25.45 
 
 		 440 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  26.46 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  24.44 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3543  O-antigen polymerase  32.58 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  28.83 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  34.41 
 
 		 595 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  32.22 
 
 		 593 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  29.57 
 
 		 661 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  30.09 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.60095 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  29.57 
 
 		 595 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  29.57 
 
 		 595 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  31.11 
 
 		 592 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  31.11 
 
 		 592 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  31.11 
 
 		 592 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  29.57 
 
 		 595 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  29.57 
 
 		 595 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  29.57 
 
 		 595 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  30 
 
 		 594 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  31.11 
 
 		 594 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2284  O-antigen polymerase  26.41 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  26.62 
 
 		 607 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>