More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1007 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 416 aa  829    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  78.55 
 
 		 419 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  75.47 
 
 		 375 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  38.01 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 		 385 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  28.47 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 810 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 762 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 800 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  39.74 
 
 		 376 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 399 aa  89.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 391 aa  89  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 448 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.89 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  30.45 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  39.55 
 
 		 822 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  28.11 
 
 		 343 aa  86.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 381 aa  86.7  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  34.65 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 		 351 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.07 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0312  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  32.89 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.04 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.05 
 
 		 769 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.9 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.76 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.35 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  34.55 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  35.06 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  32.6 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0966  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0155699  normal  0.836168 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  33.06 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  24.87 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  29.3 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  35.94 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 660 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  40.12 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.9 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>