More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1842 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  100 
 
 
200 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  94.5 
 
 
200 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.39 
 
 
200 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  77 
 
 
200 aa  330  9e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  76 
 
 
200 aa  325  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.88 
 
 
200 aa  324  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.88 
 
 
200 aa  324  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  75.38 
 
 
200 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.87 
 
 
200 aa  317  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.73 
 
 
198 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  59.69 
 
 
199 aa  260  8.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  61.22 
 
 
204 aa  259  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  60.61 
 
 
208 aa  259  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  59.09 
 
 
203 aa  254  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  60.2 
 
 
204 aa  253  9e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  59.69 
 
 
198 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  58.08 
 
 
208 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.07 
 
 
200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  54.87 
 
 
198 aa  232  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.81 
 
 
204 aa  215  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  52.31 
 
 
209 aa  208  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  50.5 
 
 
201 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  50.25 
 
 
203 aa  201  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  50.25 
 
 
203 aa  201  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  52.38 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  50 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  50 
 
 
197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  50.26 
 
 
218 aa  195  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  51.05 
 
 
195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.75 
 
 
195 aa  194  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  50.25 
 
 
195 aa  193  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.92 
 
 
192 aa  184  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  48.11 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  47.37 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  48.37 
 
 
196 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.6 
 
 
203 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  45.99 
 
 
204 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  46.2 
 
 
196 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.43 
 
 
216 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  45.54 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  46.04 
 
 
256 aa  171  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.83 
 
 
208 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  45.27 
 
 
228 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  45.77 
 
 
217 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  42.79 
 
 
216 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  45.54 
 
 
217 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  44.78 
 
 
228 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  40.2 
 
 
207 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.59 
 
 
203 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  41.54 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.28 
 
 
201 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  43.81 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 
214 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 
214 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 
221 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  34.67 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  37.86 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.18 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  38.31 
 
 
199 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  33.67 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.16 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  37.82 
 
 
214 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 
209 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  37.82 
 
 
214 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  37.82 
 
 
266 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 
227 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  38 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  34.67 
 
 
209 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  37.31 
 
 
214 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  33.17 
 
 
208 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  40.41 
 
 
207 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  36.14 
 
 
225 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  37.31 
 
 
297 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  37.31 
 
 
300 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  36.79 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  34.72 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  35.5 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  34.85 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  33.87 
 
 
222 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  35 
 
 
220 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
208 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  33.17 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  35.03 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  35.18 
 
 
197 aa  111  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  33.5 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  39.18 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  35.32 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  33.16 
 
 
205 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  30.15 
 
 
214 aa  108  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  31.41 
 
 
222 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  38.61 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  33.17 
 
 
227 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  34.83 
 
 
213 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  31.72 
 
 
222 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.82 
 
 
203 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.26 
 
 
222 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.26 
 
 
222 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>