More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0602 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  65.14 
 
 		 219 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  49.54 
 
 		 219 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  49.54 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  49.29 
 
 		 217 aa  211  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  46.98 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1951  putative nitrate/nitrite response regulator; NarL  50.72 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120802  normal  0.965323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  47.6 
 
 		 214 aa  181  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2637  two component LuxR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 213 aa  178  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0573022  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  47.57 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01199  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarX (or NarQ)  48.08 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2425  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00984481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1919  transcriptional regulator NarL  48.08 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.11445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2402  transcriptional regulator NarL  48.08 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1371  transcriptional regulator NarL  48.08 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.213666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1704  transcriptional regulator NarL  48.08 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1330  transcriptional regulator NarL  48.08 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.724195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01209  hypothetical protein  48.08 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1388  transcriptional regulator NarL  48.08 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2318  transcriptional regulator NarL  48.33 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2900  transcriptional regulator NarL  45.97 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  41.35 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1962  transcriptional regulator NarL  48.04 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1898  transcriptional regulator NarL  48.04 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.335981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1373  transcriptional regulator NarL  48.04 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.276843  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1904  transcriptional regulator NarL  48.04 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1556  transcriptional regulator NarL  48.04 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  42.99 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  42.52 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 209 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 209 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 209 aa  168  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0646  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0492071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  41.35 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0683  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000388278  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2262  transcriptional regulator NarL  47.34 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  40.38 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  41.63 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2568  transcriptional regulator NarL  47.34 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  39.9 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  37.95 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 230 aa  154  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  40.1 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  40.1 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  38.46 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  39.9 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  40.1 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  40.1 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  40.1 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  39.39 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  37.5 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  37.5 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  37.5 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  37.5 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  37.5 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  37.5 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  37.5 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  37.5 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4598  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 236 aa  148  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.07 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  40.57 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.79 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  40.28 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  40.28 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>