More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1460 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0198  tryptophan synthase subunit beta  84.71 
 
 		 408 aa  709    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1460  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 406 aa  832    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184995  normal  0.0669492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  65.05 
 
 		 400 aa  535  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  65.81 
 
 		 400 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  65.3 
 
 		 402 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  65.63 
 
 		 393 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  63.99 
 
 		 400 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1687  tryptophan synthase, beta subunit  62.56 
 
 		 403 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1989  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0603681  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  61.5 
 
 		 407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0742  tryptophan synthase subunit beta  58.78 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.782615  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1700  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 407 aa  464  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.605674  hitchhiker  0.0000000413571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1513  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0165  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522079  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2965  tryptophan synthase subunit beta  59.17 
 
 		 401 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.0390999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  58.69 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1358  tryptophan synthase, beta subunit  60.7 
 
 		 399 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.33574 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52286  tryptophan synthase, beta chain  57.14 
 
 		 385 aa  457  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0551  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  55.81 
 
 		 391 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 409 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  52.62 
 
 		 409 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  52.82 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  52.81 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  54.81 
 
 		 412 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  54.45 
 
 		 409 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  56.61 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  53.21 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  52.56 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  50.9 
 
 		 402 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  52.56 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  52.19 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  52.85 
 
 		 399 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  52.85 
 
 		 399 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  52.7 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  52.7 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  52.05 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  53.57 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  52.31 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  53.23 
 
 		 400 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  52.31 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  52.31 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  52.31 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  55.1 
 
 		 403 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  52.31 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1686  tryptophan synthase subunit beta  55.79 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.815496  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  53.89 
 
 		 434 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  52.7 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  52.45 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  51.41 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  52.47 
 
 		 403 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  53.89 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  54.22 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  51.28 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0101  tryptophan synthase, beta subunit  53.4 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  50.77 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  53.96 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  52.42 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  52.84 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  53.51 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  55.01 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  50.26 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  51.03 
 
 		 402 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  51.68 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  51.26 
 
 		 411 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  51.43 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  52.33 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  51.89 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  50.26 
 
 		 411 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  51.94 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  52.44 
 
 		 407 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  50.39 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  53.17 
 
 		 400 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  50.64 
 
 		 405 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  51.43 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  50.9 
 
 		 409 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  51.43 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  51.43 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  51.65 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2939  tryptophan synthase subunit beta  52.67 
 
 		 387 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  49.26 
 
 		 410 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  51.43 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  50.51 
 
 		 434 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  51.43 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  53.11 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  52.91 
 
 		 425 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4173  tryptophan synthase subunit beta  49.75 
 
 		 432 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  52.94 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  51.43 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  53.91 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  52.04 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>