55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4182 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  88.83 
 
 		 550 aa  941    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  88.1 
 
 		 546 aa  956    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  100 
 
 		 546 aa  1076    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  87.91 
 
 		 546 aa  955    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  26.7 
 
 		 586 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  25.42 
 
 		 585 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  26.36 
 
 		 600 aa  134  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.71 
 
 		 592 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.43 
 
 		 564 aa  127  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  25.48 
 
 		 565 aa  127  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  27.71 
 
 		 574 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  26.17 
 
 		 587 aa  124  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  27.52 
 
 		 564 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  26.92 
 
 		 583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.24 
 
 		 580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  26.23 
 
 		 563 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  26.08 
 
 		 610 aa  120  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  24.75 
 
 		 577 aa  120  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  26.73 
 
 		 559 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  26.58 
 
 		 574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  23.23 
 
 		 577 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  24.11 
 
 		 573 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  28.27 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  25.58 
 
 		 576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  25.77 
 
 		 580 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  28.27 
 
 		 570 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.86 
 
 		 576 aa  111  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  25.78 
 
 		 573 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  26.78 
 
 		 575 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  27.1 
 
 		 571 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.5 
 
 		 578 aa  107  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  23.26 
 
 		 636 aa  107  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  26.61 
 
 		 573 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  24.76 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  27.06 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.39 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.13 
 
 		 568 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  26.22 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  23.28 
 
 		 596 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  24.07 
 
 		 603 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  25.58 
 
 		 578 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 		 565 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  24.58 
 
 		 565 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.82 
 
 		 581 aa  90.5  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  20.71 
 
 		 579 aa  89.7  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  26.16 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  24.58 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  25.55 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.7 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  22.71 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  25.11 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.39 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  24.28 
 
 		 594 aa  53.5  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  21.01 
 
 		 577 aa  47.4  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2669  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.41 
 
 		 569 aa  44.3  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000803412  normal  0.0151204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>