250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2162 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  100 
 
 		 415 aa  838    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  73.18 
 
 		 409 aa  544  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  55.67 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  52.86 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  49.63 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  52.67 
 
 		 409 aa  391  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  53.89 
 
 		 406 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  38.52 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  41.35 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  34.2 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.57 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  31.07 
 
 		 426 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  31.07 
 
 		 426 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  30.83 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  30.83 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  29.69 
 
 		 426 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  31.45 
 
 		 429 aa  169  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  33.24 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  28.89 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.9 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  28.89 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.89 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  28.89 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  28.89 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  28.89 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  28.89 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  30.56 
 
 		 433 aa  162  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  28.64 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  31.58 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  30.32 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  30.41 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  32.08 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.29 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  28.03 
 
 		 410 aa  160  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.21 
 
 		 418 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.2 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.2 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  29.76 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.2 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.96 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  30.77 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  30.22 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  30.23 
 
 		 418 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  30.23 
 
 		 418 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  30.23 
 
 		 418 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  29.32 
 
 		 418 aa  156  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  30.23 
 
 		 418 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  30.23 
 
 		 418 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  30.23 
 
 		 418 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  29.89 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.03 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  29.89 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  29.89 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  34.6 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  30.1 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  26.3 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  26.3 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  28.57 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  30 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  29.85 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  28.85 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  28.08 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  29.78 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  29.78 
 
 		 423 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  28.68 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.59 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  28.87 
 
 		 430 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  28.5 
 
 		 423 aa  149  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0909  Amidohydrolase 3  27.07 
 
 		 418 aa  149  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0898622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  29.95 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  28.19 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  28.87 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.49 
 
 		 413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  31.82 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  31.56 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  31.56 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  31.35 
 
 		 393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  27.01 
 
 		 425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  27.63 
 
 		 417 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  28.61 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  31.2 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  31.85 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  31.27 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  31.03 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.77 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  28.01 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.52 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  26.76 
 
 		 425 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  29.92 
 
 		 432 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1112  Amidohydrolase 3  26.28 
 
 		 419 aa  142  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00316686  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  26.76 
 
 		 425 aa  142  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  27.52 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  31.41 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  27.25 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  27.3 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  27.51 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.76 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  31.27 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.99 
 
 		 395 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  26.43 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>