More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2382 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 184 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  99.42 
 
 		 172 aa  334  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  98.84 
 
 		 172 aa  333  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  90.7 
 
 		 172 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  65.45 
 
 		 194 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  58.39 
 
 		 163 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  56.73 
 
 		 174 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  57.99 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  53.29 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  59.15 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  57.14 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  58.87 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  51.5 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  49.39 
 
 		 162 aa  157  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  51.46 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00280  transporter, MgtC/SapB family  59.73 
 
 		 157 aa  141  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2277  MgtC/SapB transporter  59.56 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36780  hypothetical protein  56.74 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3158  hypothetical protein  56.03 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7027  MgtC/SapB transporter  44.71 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1768  MgtC/SapB transporter  52.05 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313608  normal  0.363956 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5985  Mg(II) transport ATPase  52.05 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000520762  normal  0.0326186 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7046  MgtC/SapB transporter  43.02 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  39.86 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  45.19 
 
 		 133 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  41.56 
 
 		 176 aa  104  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0663  putative Mg(2+) transporter  49.17 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.373124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  43.48 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  44.44 
 
 		 133 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2621  hypothetical protein  46.92 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  44.62 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  44.44 
 
 		 133 aa  101  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  43.38 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  47.2 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  40.41 
 
 		 219 aa  98.6  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  40.41 
 
 		 219 aa  98.6  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  40.41 
 
 		 219 aa  98.6  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  44.53 
 
 		 233 aa  98.6  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  43.17 
 
 		 141 aa  98.2  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  37.41 
 
 		 232 aa  98.2  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  37.58 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  44.2 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  41.67 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  40.65 
 
 		 235 aa  96.3  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  43.51 
 
 		 245 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  36.91 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  36.91 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  46.03 
 
 		 225 aa  95.5  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  36.91 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  41.91 
 
 		 238 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  36.91 
 
 		 219 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  36.91 
 
 		 219 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  36.91 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  40.94 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  36.91 
 
 		 215 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  37.34 
 
 		 240 aa  95.1  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  44.78 
 
 		 227 aa  95.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  36.67 
 
 		 168 aa  95.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  37.34 
 
 		 240 aa  94.7  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  43.94 
 
 		 170 aa  94.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  39.73 
 
 		 226 aa  93.6  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  40.41 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  39.74 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  45.3 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  43.8 
 
 		 238 aa  93.2  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  46.38 
 
 		 226 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  33.53 
 
 		 167 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1926  MgtC/SapB transporter  42.86 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2836  MgtC/SapB transporter  40.79 
 
 		 175 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  43.17 
 
 		 225 aa  92.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1889  MgtC/SapB transporter  38.16 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.296352  normal  0.742707 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  44.09 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  44.09 
 
 		 225 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  44.09 
 
 		 225 aa  92  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  44.09 
 
 		 225 aa  92  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  38.1 
 
 		 234 aa  92  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  44.09 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  38 
 
 		 231 aa  92  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  40.98 
 
 		 223 aa  92  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  44.09 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  43.31 
 
 		 225 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1595  MgtC/SapB transporter  40.27 
 
 		 158 aa  90.9  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2363  MgtC/SapB transporter  43.05 
 
 		 150 aa  90.9  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  43.48 
 
 		 226 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  44.88 
 
 		 225 aa  90.9  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  41.38 
 
 		 244 aa  90.9  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  43.31 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  48.28 
 
 		 226 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0789  MgtC/SapB transporter  44.3 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  48.33 
 
 		 240 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  42.11 
 
 		 164 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  39.44 
 
 		 228 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  43.31 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  39.6 
 
 		 237 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  34.44 
 
 		 248 aa  89.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  39.04 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  42.64 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  45.99 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  39.6 
 
 		 237 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  40.16 
 
 		 228 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>